RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 SLC39A2Q9NP94 309 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 GDAQ9Y2T3 454 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 BMP6P22004 513 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 SLC26A2P50443 739 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 PEX3P56589 373 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 DPYDQ12882 1025 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 LRRC26Q2I0M4 334 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 SFR1Q86XK3 245 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 KATNAL1Q9BW62 490 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 CLSTN2Q9H4D0 955 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 PHF24Q9UPV7 400 aa12.04□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 NOD1Q9Y239 953 aa12.04□□□□□ -0.48
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TTPA-201ENST00000260116 NMT1P30419 496 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 NKX3-2P78367 333 aa12.03□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 ADAM17P78536 824 aa12.03□□□□□ -0.48
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TTPA-201ENST00000260116 TNS4Q8IZW8 715 aa12.03□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 TMEM40Q8WWA1 233 aa12.03□□□□□ -0.48
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TTPA-201ENST00000260116 DGAT1O75907 488 aa12.03□□□□□ -0.48
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TTPA-201ENST00000260116 KMT5BQ4FZB7 885 aa12.03□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 ODR4Q5SWX8 454 aa12.03□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa12.03□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 MYCT1Q8N699 235 aa12.03□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
TTPA-201ENST00000260116 FAM167AQ96KS9 214 aa12.03□□□□□ -0.48
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TTPA-201ENST00000260116 PANK4Q9NVE7 773 aa12.03□□□□□ -0.48
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TTPA-201ENST00000260116 TISP43B9A030 160 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SLC16A4O15374 487 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 MAFO75444 373 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 IQCF3P0C7M6 154 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 GLRA2P23416 452 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 COASYQ13057 564 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 RNF149Q8NC42 400 aa12.02□□□□□ -0.49
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TTPA-201ENST00000260116 MINDY3Q9H8M7 445 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 A0A087WZ62 844 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 ARVCFO00192 962 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP12.02□□□□□ -0.49
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TTPA-201ENST00000260116 MYBP10242 640 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 COL6A1P12109 1028 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 THPOP40225 353 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 TLE2Q04725 743 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CAPSQ13938 189 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SCLT1Q96NL6 688 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.02□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 REV3LO60673 3130 aa12.01□□□□□ -0.49
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TTPA-201ENST00000260116 EDN1P05305 212 aa12.01□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 ITGB8P26012 769 aa12.01□□□□□ -0.49
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TTPA-201ENST00000260116 FAM126BQ8IXS8 530 aa12.01□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 KIAA0895Q8NCT3 520 aa12.01□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 C11orf49Q9H6J7 331 aa12.01□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CHD9Q3L8U1 2897 aa12.01□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 MUTP22033 750 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 NPTX2P47972 431 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CCL23P55773 120 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 ZNF484Q5JVG2 852 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 CCDC183Q5T5S1 534 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 KLHL10Q6JEL2 608 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 NLRP7Q8WX94 980 aa12□□□□□ -0.49
TTPA-201ENST00000260116 SMARCE1Q969G3 411 aa12□□□□□ -0.49
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