RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 RPN1P04843 607 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ASGR1P07306 291 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP3A4P08684 503 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF76P36508 570 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 VSNL1P62760 191 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 HSDL1Q3SXM5 330 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CYFIP1Q7L576 1253 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC7Q99615 494 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCL17Q6UXB2 119 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS16Q9H269 839 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 Q9Y3F1 56 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP290O15078 2479 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 KBTBD13C9JR72 458 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 TDP2O95551 362 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 TGFB3P10600 412 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNA2P16389 499 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ACLYP53396 1101 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNB1Q14721 858 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRX1Q86UT6 975 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 GJA10Q969M2 543 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 GPRASP2Q96D09 838 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 THAP9Q9H5L6 903 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SPC25Q9HBM1 224 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0U1RQJ8 604 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 WNT7AO00755 349 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 GH1P01241 217 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOXF2BP0C7M4 288 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 NKX3-2P78367 333 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SP4Q02446 784 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 UBXN1Q04323 297 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 STIM1Q13586 685 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 NECAB2Q7Z6G3 386 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 RETREG2Q8NC44 543 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ATRIPQ8WXE1 791 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 LENG9Q96B70 501 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOXF2Q9BQY4 288 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf49Q9H6J7 331 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 LGALS16A8MUM7 142 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CST5P28325 142 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CASP1P29466 404 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR16Q569H4 304 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP58Q9BVL2 599 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 RASSF4Q9H2L5 321 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 TAB2Q9NYJ8 693 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPN11Q9UMQ6 739 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 MCTP2Q6DN12 878 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT25Q7Z3Z0 450 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 IQCDQ96DY2 449 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PQY0 241 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NJR5 290 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF24Q9UPV7 400 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 CIITAP33076 1130 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 LETM2Q2VYF4 491 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNV1Q6PIU1 500 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ADSSL1Q8N142 457 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 MLXIPQ9HAP2 919 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ALPK3Q96L96 1907 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 IQCEQ6IPM2 695 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SRLQ86TD4 932 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 RUBCNQ92622 972 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA33Q96N06 139 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SAR1BQ9Y6B6 198 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ANO9A1A5B4 782 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT86O43790 486 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP3P08254 477 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R2P41236 205 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 DNM2P50570 870 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 USP11P51784 963 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMC6P62333 389 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC170Q8IYT3 715 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 BLZF1Q9H2G9 400 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEF1Q9HAY2 307 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 FAN1Q9Y2M0 1017 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 MYL3P08590 195 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMC2Q13753 1193 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 MEA1Q16626 185 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC26Q2I0M4 334 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 MTRQ99707 1265 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 SENP7Q9BQF6 1050 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO1CO00159 1063 aa28.87■■■□□ 2.21
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