RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa23.71■■□□□ 1.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmx4Q8C0L0 335 aa23.71■■□□□ 1.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm2030D3Z7C4 212 aa23.71■■□□□ 1.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Npdc1Q64322 332 aa23.71■■□□□ 1.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Calcoco1Q8CGU1 691 aa23.71■■□□□ 1.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hebp1Q9R257 190 aa23.71■■□□□ 1.39
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PtenO08586 403 aa23.7■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Clcn6O35454 870 aa23.7■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sema6bO54951 886 aa23.7■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tatdn3Q3U1C6 294 aa23.7■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp2r5eQ61151 467 aa23.7■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GmipQ6PGG2 971 aa23.7■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 FtoQ8BGW1 502 aa23.7■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lztr1Q9CQ33 837 aa23.7■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Osbpl7A2A716 963 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Klc1O88447 541 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CraddO88843 199 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hspa1lP16627 641 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GcP21614 476 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cyp26b1Q811W2 512 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc17a8Q8BFU8 601 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nemp2Q8CB65 421 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Epn2Q8CHU3 595 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Extl2Q9ES89 330 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kmt2eQ3UG20 1868 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Idh1O88844 414 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NrcamQ810U4 1256 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PhykplQ8R1K4 467 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc14a1Q8VHL0 384 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dph5Q9CWQ0 281 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa23.69■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Psme4Q5SSW2 1843 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trappc3O55013 180 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stk10O55098 966 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam20aQ8CID3 541 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc25a38Q91XD8 326 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hoxa11P31311 313 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cd68P31996 326 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hnrnph2P70333 449 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc84Q4VA36 332 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ndufaf2Q59J78 168 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp2r2aQ6P1F6 447 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Btbd7Q8CFE5 1130 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Acat1Q8QZT1 424 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cgref1Q8R1U2 281 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tnip1Q9WUU8 647 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Myh11O08638 1972 aa23.68■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttc13A0A1L1SSC7 844 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Magea4F2Z493 315 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gimap9G3X987 291 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rnaseh1O70338 285 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cyfip2Q5SQX6 1253 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttyh3Q6P5F7 524 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ints2Q80UK8 1198 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vgll2Q8BGW8 322 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lmo3Q8BZL8 145 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tex11Q14AT2 947 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 BC051142Q3V0M8 400 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 HnrnpdQ60668 355 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gas7Q60780 421 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Churc1Q6DG52 112 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TbataQ7TSD4 393 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rassf10Q8BL43 508 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim47Q8C0E3 641 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Spdl1Q923A2 608 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttc5Q99LG4 440 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Psma8Q9CWH6 250 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cmtm5Q9D6G9 156 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cabp5Q9JLK3 173 aa23.67■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa23.66■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cntnap1O54991 1385 aa23.66■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc35g2D3YVE8 412 aa23.66■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Edem3Q2HXL6 931 aa23.66■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Large2Q5XPT3 690 aa23.66■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rgl1Q60695 768 aa23.66■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Q8BGD0 127 aa23.66■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Appl2Q8K3G9 662 aa23.66■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SfpqQ8VIJ6 699 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MycbpQ9EQS3 103 aa23.66■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Btaf1E9QAE3 1848 aa23.66■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fbf1A2A870 1173 aa23.65■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wfs1P56695 890 aa23.65■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Acot6Q32Q92 419 aa23.65■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Oca2Q62052 833 aa23.65■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lrrc45Q8CIM1 670 aa23.65■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dennd1aQ8K382 1016 aa23.65■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa23.65■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hsf3D0VYS2 492 aa23.65■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CatspereP0DP43 985 aa23.65■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmod1P49813 359 aa23.65■■□□□ 1.38
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zbtb7bQ64321 544 aa23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.5 ms