RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023054.13

Apobec3-201, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 1,842 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lrig3Q6P1C6 1117 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Usp17leQ7M764 540 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 TbckQ8BM85 762 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 OtoaQ8K561 1137 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tada3Q8R0L9 432 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 TxlnbQ8VBT1 685 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Olfr805Q8VFI4 319 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 IrgqQ8VIM9 583 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mov10l1Q99MV5 1187 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dbndd2Q9CRD4 158 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Serpina9Q9D7D2 418 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cse1lQ9ERK4 971 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rilpl1Q9JJC6 406 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Scn10aQ6QIY3 1958 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Abcb11Q9QY30 1321 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Megf6Q80V70 1572 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ttll6A4Q9E8 822 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Snx12O70493 165 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc3a2P10852 526 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 PrkceP16054 737 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 RenbpP82343 430 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pou2f2Q00196 463 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sox10Q04888 466 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nhej1Q3KNJ2 295 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cyp11b1Q3TG86 501 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lrig2Q52KR2 1054 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tmem232Q5K6N0 675 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 6820408C15RikQ8BJX2 354 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rab11fip4Q8BQP8 635 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ppme1Q8BVQ5 386 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc9a9Q8BZ00 644 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rassf4Q8CB96 322 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Btbd7Q8CFE5 1130 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Syne4Q8CII8 388 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tlr5Q9JLF7 859 aa10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Prpf40aQ9R1C7 953 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Klhdc7aA2APT9 773 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Oog1E9Q5G7 496 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Capn2O08529 700 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nkx2-5P42582 318 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gad1P48318 593 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 MafbP54841 323 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Meis3P97368 378 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tarbp2P97473 365 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ripply1Q2WG77 201 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pdlim7Q3TJD7 457 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc16a10Q3U9N9 512 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rapgef1Q3UHC1 1224 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Atp13a4Q5XF90 1193 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Papd7Q6PB75 542 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Zbtb5Q7TQG0 670 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cnksr2Q80YA9 1032 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Hsdl1Q8BTX9 330 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fam53cQ8BXQ8 393 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lin9Q8C735 542 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Znf445Q8R2V3 986 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Acot11Q8VHQ9 594 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rrp1bQ91YK2 724 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Uap1Q91YN5 522 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Hspbp1Q99P31 357 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rnf6Q9DBU5 667 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa10.18□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm10110D3Z5M2 615 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 AunipE9Q6Z5 340 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 GcP21614 476 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Adcy7P51829 1099 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 LxnP70202 222 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gjb6P70689 261 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tcp11Q01755 566 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Top1Q04750 767 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gpr162Q3UN16 588 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Carmil2Q3V3V9 1296 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Antxr2Q6DFX2 487 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Moxd2Q7TT41 619 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Prdm4Q80V63 803 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 HomezQ80W88 542 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Hook3Q8BUK6 718 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Azin2Q8BVM4 459 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc13a4Q8BZ82 625 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Angel2Q8K1C0 544 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ttc8Q8VD72 515 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 EpgnQ924X1 152 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Vwa5aQ99KC8 793 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sdr42e1Q9D665 394 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mzb1Q9D8I1 188 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 SisF8VQM5 1818 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ttc6G3UYY4 1857 aa10.17□□□□□ -0.78
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rsrc2A2RTL5 376 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.3 ms