RNA–Protein interactions for RNA: YOL083W

ATG34, Transcript of Receptor protein involved in selective autophagy during starvation, yeast

Gene ATG34, Length 1,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG34	YOL083W	GRR1	P24814	1151 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	IES6	P32617	166 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	VAC7	P53950	1165 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YLH47	Q06493	454 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YOR338W	Q99326	363 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	FSH3	Q99369	266 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	MAS1	P10507	462 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	FAR1	P21268	830 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	GIT1	P25346	518 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	MRP21	P38175	177 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	MSC3	Q05812	728 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YDL109C	Q12103	647 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	STE3	P06783	470 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	CMK2	P22517	447 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	DEP1	P31385	405 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	POP2	P39008	433 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	EFM3	P47163	339 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	AQR1	P53943	586 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	MRPS16	Q02608	121 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	SMP3	Q04174	516 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	SFM1	Q12314	213 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	HMS1	Q12398	434 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	HEM4	P06174	275 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YEL043W	P32618	956 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	RRF1	P38771	230 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YHR182W	P38870	785 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	IGD1	P43598	195 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YPS5	P53057	165 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	ATP16	Q12165	160 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	PSY3	Q12318	242 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	STE7	P06784	515 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	CKI1	P20485	582 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	SAG1	P20840	650 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	HMX1	P32339	317 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YHR122W	P38829	231 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	ATG7	P38862	630 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YJR030C	P47101	745 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YOR376W	Q08900	122 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	SLM3	Q12093	417 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	PSK1	P31374	1356 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	MRPS5	P33759	307 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YKR015C	P36111	568 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	UIP5	P36137	443 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	SOL2	P37262	315 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	GPI18	P38211	433 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	LST7	P53237	242 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	VHT1	P53241	593 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	VTI1	Q04338	217 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	FSH2	Q05015	223 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YLR177W	Q06251	628 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	UNG1	P12887	359 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	LDS1	P31379	325 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	SMI1	P32566	505 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	BMT2	P38278	337 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	WSC4	P38739	605 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	NAS2	P40555	220 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	YHC3	P47040	408 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	YGR018C	P53211	109 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	PRM1	P53835	661 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	REX3	Q12090	404 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	UBA3	Q99344	299 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	STF1	P01098	86 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	HXT2	P23585	541 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	MXR2	P25566	168 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	PMT2	P31382	759 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	IST2	P38250	946 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	YGL262W	P53054	175 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	NAT4	Q04751	285 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	APC5	Q08683	685 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	GLE1	Q12315	538 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATG34	YOL083W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92

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