RNA–Protein interactions for RNA: YNR042W

YNR042W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNR042W, Length 429 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR042W	YNR042W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	CLG1	P35190	452 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	SWH1	P35845	1188 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	MRPL10	P36520	322 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	MRPL16	P38064	232 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	COS4	P43542	379 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	PEF1	P53238	335 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YGR126W	P53274	230 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	MTM1	P53320	366 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	GOR1	P53839	350 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	ECM11	Q04110	302 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	STE23	Q06010	1027 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	SNA4	Q07549	140 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	ENB1	Q08299	606 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	GRE1	Q08969	168 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	UNG1	P12887	359 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	SCO1	P23833	295 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	CTR86	P25355	563 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	PHA2	P32452	334 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	NGG1	P32494	702 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YHR180W	P38868	163 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	SMK1	P41808	388 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YJR154W	P47181	346 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	GTO1	P48239	356 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	SHE4	P51534	789 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	AIF1	P52923	378 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	GMC1	Q04399	608 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	SRL1	Q08673	210 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	MUM3	Q08750	479 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	GPB1	Q08886	897 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	NPC2	Q12408	173 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	ATP4	P05626	244 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	PHO81	P17442	1178 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	MIG1	P27705	504 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	CTS1	P29029	562 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	PPG1	P32838	368 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	COS9	P36034	407 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	FLO5	P38894	1075 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	PSD1	P39006	500 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	COG3	P40094	801 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	SLT2	Q00772	484 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	IRC15	Q02733	499 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	MMT1	Q03218	510 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	VPS71	Q03433	280 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	URC2	Q04411	772 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	VPS74	Q06385	345 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YET3	Q07451	203 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	ERP4	Q12450	207 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	CLB6	P32943	380 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	ETR1	P38071	380 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	FIG1	P38224	298 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	PIC2	P40035	300 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	SEC9	P40357	651 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	TAX4	P47030	604 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	GTR2	P53290	341 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	APJ1	P53940	528 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YNL046W	P53956	172 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	NAT4	Q04751	285 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR042W	YNR042W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	OCA4	P25366	362 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	HEM3	P28789	327 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	MTC7	P32633	139 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	SCO2	P38072	301 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	RBG1	P39729	369 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	YJL068C	P40363	299 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	DJP1	P40564	432 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	COS1	P53822	381 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	URH1	Q04179	340 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	IRC19	Q07843	230 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	GAT3	Q07928	141 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR042W	YNR042W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.5 ms