RNA–Protein interactions for RNA: YLR141W

RRN5, Transcript of Protein involved in transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeast

Gene RRN5, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN5	YLR141W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	RPL43B	P0CX26	92 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	RAD51	P25454	400 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	YKR073C	P36153	106 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	YHL012W	P38709	493 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	ECL1	P48235	211 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	EKI1	Q03764	534 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	BUR2	Q05949	395 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	RDR1	Q08904	546 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		13.12	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	YOL163W	P0CF20	169 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	APE4	P38821	490 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	GPI16	P38875	610 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	YHR219W	P38900	624 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	RCY1	P39531	840 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	SWA2	Q06677	668 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	CLB4	P24871	460 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	ATS1	P31386	333 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	HIR2	P32480	875 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	RPN14	P53196	417 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	MEP3	P53390	489 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	MCP1	Q12106	302 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	YOL087C	Q99247	1116 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	PHO2	P07269	559 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	ERD2	P18414	219 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	YIL169C	P40442	995 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	RMR1	P53060	241 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	SNX41	Q04053	625 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	FMP45	Q07651	309 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RRN5	YLR141W	CDC4	P07834	779 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	PBS2	P08018	668 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	ITR2	P30606	609 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	HCS1	P34243	683 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	REE1	P40893	198 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YJR142W	P47173	342 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YGR016W	P53209	190 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YSA1	Q01976	231 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	SDC1	Q03323	175 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	CRT10	Q08226	957 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	HNT3	Q08702	217 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	SWM1	Q12379	170 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	SPC34	P36131	295 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	APD1	P38281	316 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YEL068C	P39977	110 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YER010C	P40011	234 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	VHR1	P40522	640 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	BSC5	P53755	489 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YLR352W	Q06479	807 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	NDL1	Q06568	189 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	HDA2	Q06629	674 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	ENB1	Q08299	606 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	DFG16	Q99234	619 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	CTA1	P15202	515 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	EHD3	P28817	500 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	AGP3	P43548	558 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	MNN5	P46982	586 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	BUD9	P53226	547 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	AVO1	Q08236	1176 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	ERG9	P29704	444 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	HXT9	P40885	567 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	PRY1	P47032	299 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	MRK1	P50873	501 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YNL092W	P53934	400 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	HXT11	P54862	567 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YDR239C	Q03780	787 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	NFS1	P25374	497 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YCR100C	P25606	316 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	ECM15	P35195	104 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	SRO77	P38163	1010 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	PEX18	P38855	283 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	ERP6	P53198	216 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YKR011C	Q02209	353 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	HFD1	Q04458	532 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	GAS2	Q06135	555 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	SYO1	Q07395	620 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YDL109C	Q12103	647 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	FLO9	P39712	1322 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	SIR3	P06701	978 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	SNF4	P12904	322 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YAK1	P14680	807 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	PTC6	P25646	442 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	YHR180W	P38868	163 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	SHE4	P51534	789 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	COX20	Q04935	205 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RRN5	YLR141W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32

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