RNA–Protein interactions for RNA: YKL125W

RRN3, Transcript of Protein required for transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeastyeast

Gene RRN3, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3YKL125W YBR053CP38235 358 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W BIT2P38346 545 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W PHO89P38361 574 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SHU2P38957 223 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ICP55P40051 511 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MCM22P47167 239 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W HXT16P47185 567 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MRX6P48564 524 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YGL138CP53122 345 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W BUD32P53323 261 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YNL095CP53932 642 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W NUP49Q02199 472 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SMA1Q02651 245 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MSC1Q03104 513 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W HOF1Q05080 669 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W INP53Q12271 1107 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W VMA9Q3E7B6 73 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W FSH3Q99369 266 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W FLO11P08640 1367 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MOT1P32333 1867 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W DST1P07273 309 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ERR1P0CX10 437 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ERR2P0CX11 437 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W REV1P12689 985 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data5.01□□□□□ -1.61not detected
RRN3YKL125W HOP1P20050 605 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W NPR1P22211 790 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W DCC1P25559 380 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W PEX34P25584 144 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W PAH1P32567 862 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W TIM23P32897 222 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W HSL7P38274 827 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W GLR1P41921 483 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ERR3P42222 437 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SOL1P50278 321 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W NBP35P52920 328 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YGL204CP53089 101 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YPL014WQ02606 381 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YPL080CQ02826 108 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YMR209CQ03648 457 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RKM2Q03942 479 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SHH3Q04487 196 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W FRQ1Q06389 190 aa5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W PST2Q12335 198 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W PRC1P00729 532 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W IDP1P21954 428 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W AGP1P25376 633 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W TRK2P28584 889 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SNC1P31109 117 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W CAT2P32796 670 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SKT5P34226 696 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W TUL1P36096 758 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MRPL36P36531 177 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W DTR1P38125 572 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SHE3P38272 425 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W EHT1P38295 451 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SUR2P38992 349 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YJL045WP47052 634 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W BNA1P47096 177 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W GND2P53319 492 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SSU72P53538 206 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YDC1Q02896 317 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W TDA1Q03533 586 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MSC3Q05812 728 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W TGS1Q12052 315 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data5□□□□□ -1.61not detected
RRN3YKL125W YLR046CQ12253 270 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SPS2P08459 502 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W CKA1P15790 372 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W CSM1P25651 190 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ACB1P31787 87 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W AEP1P32493 518 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W EMP24P32803 203 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W CSG2P35206 410 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W TVP38P36164 337 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data5□□□□□ -1.61not detected
RRN3YKL125W TOS1P38288 455 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YBR184WP38299 523 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SNM1P40993 198 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SSU1P41930 458 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W NIT2P47016 307 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YGL185CP53100 379 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W LSM7P53905 115 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W KIN4Q01919 800 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W STD1Q02794 444 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W UBP16Q02863 499 aa5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W TCO89Q08921 799 aa5□□□□□ -1.61
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