RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	VPS54	Q12071	889 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RUP1	Q12242	671 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	LDB17	Q12342	491 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RPB9	P27999	122 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	LDS1	P31379	325 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	MKK1	P32490	508 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YSC83	P32792	385 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YMR262W	P38430	313 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	NRM1	P53718	249 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	GTO3	Q04806	366 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	NSE1	Q07913	336 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	UAF30	Q08747	228 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SLM3	Q12093	417 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YDL109C	Q12103	647 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YDR018C	Q12185	396 aa		0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	CPT1	P17898	393 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	CKA2	P19454	339 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	CLB1	P24868	471 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	MIG1	P27705	504 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.52	□□□□□ -2.33	not detected
BLI1	YKL061W	TIP20	P33891	701 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	DOA1	P36037	715 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	ECM14	P38836	430 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	FAD1	P38913	306 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	GGC1	P38988	300 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	RBG1	P39729	369 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	AIM23	P47015	356 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	ROG1	P53118	685 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YGL088W	P53151	121 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	RGM1	Q00453	211 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	SLT2	Q00772	484 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YLR287C	Q05881	355 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	GAS2	Q06135	555 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YLH47	Q06493	454 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	MED2	Q12124	431 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	HMS1	Q12398	434 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YOR338W	Q99326	363 aa		0.52	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	STE2	D6VTK4	431 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	CUP2	P15315	225 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	SNF6	P18888	332 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	REC107	P21651	314 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	DAL81	P21657	970 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	NFU1	P32860	256 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	COS9	P36034	407 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	BYE1	P36106	594 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	MED6	P38782	295 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YHR177W	P38867	453 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	PCL7	P40186	285 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	EFM3	P47163	339 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	NAS6	P50086	228 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	PRM1	P53835	661 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	APC4	Q04601	652 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	ECM19	Q06011	112 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	AEP3	Q12089	606 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	FRE8	Q12209	686 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	SFI1	Q12369	946 aa		0.51	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.5	□□□□□ -2.33	not detected
BLI1	YKL061W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	MET2	P08465	486 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	KRE1	P17260	313 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	CPR2	P23285	205 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	PHO91	P27514	894 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	ATG12	P38316	186 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	TAE1	P38340	232 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YER084W	P40057	128 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	RRG9	P40156	214 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	SUR7	P54003	302 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	MDM1	Q01846	1127 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	MEH1	Q02205	184 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YMR244W	Q04018	355 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	VTI1	Q04338	217 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	YDR222W	Q04925	415 aa		0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
BLI1	YKL061W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33

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