RNA–Protein interactions for RNA: YKL006C-A

SFT1, Transcript of Intra-Golgi v-SNARE, yeast

Gene SFT1, Length 294 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFT1	YKL006C-A	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	YCL068C	P25593	260 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	MSK1	P32048	576 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	YPS1	P32329	569 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	SKN1	P33336	771 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	COY1	P34237	679 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	MRPL37	P36532	105 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	CHK1	P38147	527 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	HSM3	P38348	480 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	ATM1	P40416	690 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	SNL1	P40548	159 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	RET3	P53600	189 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	MMT1	Q03218	510 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	CCE1	Q03702	353 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	CSI1	Q04368	295 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	AIM33	Q04516	312 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	ERV41	Q04651	352 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	LDB17	Q12342	491 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	JID1	Q12350	301 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	UNG1	P12887	359 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	BUD2	P33314	1104 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	RTC2	P38279	296 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	COX14	P39103	70 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	TOS3	P43637	560 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	BIR1	P47134	954 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	STE24	P47154	453 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	GTO1	P48239	356 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	MND1	P53102	219 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	ARR1	Q06596	294 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	ASA1	Q06822	443 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	SRL2	Q12020	392 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	TY3A-G	Q12173	290 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	YDR262W	Q12331	272 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	TY3A-I	Q99219	290 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	FAB1	P34756	2278 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SFT1	YKL006C-A	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	MSI1	P13712	422 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	PRR1	P28708	518 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	IES6	P32617	166 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	TOA2	P32774	122 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	COT1	P32798	439 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	SBE22	P38814	852 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
SFT1	YKL006C-A	SCC4	P40090	624 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	SIM1	P40472	476 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	MRM2	P53123	320 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	VOA1	P53262	265 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	SMP3	Q04174	516 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	RIF2	Q06208	395 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	ARV1	Q06541	321 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	FSH3	Q99369	266 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	CHD1	P32657	1468 aa		2.58	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	CTM1	P38818	585 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	OXA1	P39952	402 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	HAC1	P41546	238 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	LOH1	P47055	219 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	LSB1	P53281	241 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	YNL050C	P53952	270 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	VHS1	Q03785	461 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	APC4	Q04601	652 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	YLL007C	Q07799	665 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	LDS2	Q08218	356 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	GLE1	Q12315	538 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	FMP16	Q12497	93 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	CCH1	P50077	2039 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	PSK1	P31374	1356 aa		2.57	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	YLL053C	P0CD98	152 aa		2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	MAS2	P11914	482 aa		2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	CKI1	P20485	582 aa		2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	CIN8	P27895	1000 aa		2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	ECT1	P33412	323 aa		2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	DOA1	P36037	715 aa		2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	FET3	P38993	636 aa		2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	YMR134W	P40207	237 aa		2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	MAM33	P40513	266 aa		2.56	□□□□□ -2
SFT1	YKL006C-A	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2

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