RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626622.1

AC183088.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC183088.1, Length 3,398 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC183088.1-201ENST00000626622 ADCY2Q08462 1091 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 LONRF1Q17RB8 773 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 JAMLQ86YT9 394 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 LRRC57Q8N9N7 239 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 TLCD1Q96CP7 247 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 EYA3Q99504 573 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 LZTS2Q9BRK4 669 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 TRIM7Q9C029 511 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 GCNT4Q9P109 453 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 PNMA3Q9UL41 463 aa11.71□□□□□ -0.53
AC183088.1-201ENST00000626622 H0Y3Z8 333 aa11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 PPFIA2O75334 1257 aa11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 KRT16P08779 473 aa11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 STX2P32856 288 aa11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 C12orf60Q5U649 245 aa11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 AADACL2Q6P093 401 aa11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 BARGINQ6ZT62 677 aa11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 CENPTQ96BT3 561 aa11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 C18orf8Q96DM3 657 aa11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 EBF2Q9HAK2 575 aa11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.71□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 POTEB3A0JP26 581 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 POTECB2RU33 542 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 MEIS1O00470 390 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 CES2O00748 559 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 SNX3O60493 162 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 SMIM24O75264 130 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 COPS2P61201 443 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 CALCOCO2Q13137 446 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ECM1Q16610 540 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 POTEBQ6S5H4 581 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 PIGWQ7Z7B1 504 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 MINPP1Q9UNW1 487 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 AGTP01019 485 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 PON1P27169 355 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 MSH2P43246 934 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 MMP13P45452 471 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 NCALDP61601 193 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 GANQ9H2C0 597 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 SLC12A4Q9UP95 1085 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 KCNJ1P48048 391 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 SLMAPQ14BN4 828 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 FBF1Q8TES7 1133 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ZNF570Q96NI8 536 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 TMEM120BA0PK00 339 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 USP17L5A8MUK1 530 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 FOXO6A8MYZ6 492 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 BAG3O95817 575 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 VPS41P49754 854 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 MXRA7P84157 204 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 PARP10Q53GL7 1025 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 PGM2Q96G03 612 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 SH3GL3Q99963 347 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 LRRN2O75325 713 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 RIPK1Q13546 671 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.69□□□□□ -0.54
AC183088.1-201ENST00000626622 SFI1A8K8P3 1242 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms