RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	ADCY8	P40145	1251 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	STK4	Q13043	487 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SPARCL1	Q14515	664 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	STAT4	Q14765	748 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TAF11	Q15544	211 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	HLF	Q16534	295 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SUSD4	Q5VX71	490 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	KRT39	Q6A163	491 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FAM210A	Q96ND0	272 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	GBP5	Q96PP8	586 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PIGS	Q96S52	555 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	STK33	Q9BYT3	514 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PARVG	Q9HBI0	331 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SENP2	Q9HC62	589 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	NCK2	O43639	380 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	KRT14	P02533	472 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	NR3C1	P04150	777 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ABCB4	P21439	1286 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	BTD	P43251	543 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CDK8	P49336	464 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FNTA	P49354	379 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SNX16	P57768	344 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	E2F5	Q15329	346 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SGO2	Q562F6	1265 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PCGF5	Q86SE9	256 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CNBD1	Q8NA66	436 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	BICD1	Q96G01	975 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	PGM2	Q96G03	612 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SERPINB12	Q96P63	405 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ACCS	Q96QU6	501 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ERP44	Q9BS26	406 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790		Q9H521	79 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	THEG	Q9P2T0	379 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		3.81	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	3.81	□□□□□ -1.8	5e-7	■■■■■ 27.4
VMP1-216	ENST00000592790	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FAM205C	A6NFA0	338 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SMAP	O00193	183 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ZBTB5	O15062	677 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	GAS7	O60861	476 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	UFL1	O94874	794 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FGR	P09769	529 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FCER1A	P12319	257 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ITIH2	P19823	946 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SLC1A1	P43005	524 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SIK1	P57059	783 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	FBXO11	Q86XK2	927 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	RAB20	Q9NX57	234 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
VMP1-216	ENST00000592790	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8

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