RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, human

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRS-209	ENST00000591760	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	HAS1	Q92839	578 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	OSMR	Q99650	979 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	REV3L	O60673	3130 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	DLL1	O00548	723 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	GPR182	O15218	404 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	28.92	■■■□□ 2.22	5e-9	■■■■■ 40.8
PTPRS-209	ENST00000591760	GPR32	O75388	356 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	THEG	Q9P2T0	379 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	EML1	O00423	815 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	RABEP1	Q15276	862 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	MTERF2	Q49AM1	385 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	FIBCD1	Q8N539	461 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	TMX1	Q9H3N1	280 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	STAG3L1	P0CL83	205 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	EPC2	Q52LR7	807 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	C8orf76	Q96K31	380 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	VCAN	P13611	3396 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	DENND3	A2RUS2	1198 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	DGKI	O75912	1065 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	STBD1	O95210	358 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PTPRS-209	ENST00000591760	TMEM150B	A6NC51	233 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	NEMF	O60524	1076 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	EPHA7	Q15375	998 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	CALCRL	Q16602	461 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	ANO5	Q75V66	913 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM228A	Q86W67	206 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	TMEM192	Q8IY95	271 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	IL27	Q8NEV9	243 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	SCLT1	Q96NL6	688 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	ST18	O60284	1047 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	DNM2	P50570	870 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	GUCY1B3	Q02153	619 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	CEP89	Q96ST8	783 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	GPC3	P51654	580 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	CDC42EP1	Q00587	391 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	ADAM2	Q99965	735 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	LXN	Q9BS40	222 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	RGS18	Q9NS28	235 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	MGEA5	O60502	916 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	CTNNB1	P35222	781 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	PTPRO	Q16827	1216 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	NLRP7	Q8WX94	980 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	PPME1	Q9Y570	386 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760		H3BNC9	293 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	C4orf19	Q8IY42	314 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRS-209	ENST00000591760	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21

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