RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	CAND2	O75155	1236 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	PPP6R2	O75170	966 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	RFC5	P40937	340 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	ME1	P48163	572 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	RARRES1	P49788	294 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	RBL2	Q08999	1139 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	27.8	■■■□□ 2.04	8e-11	■■■□□ 14.9
GPS1-223	ENST00000584229	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	SPATA32	Q96LK8	384 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	MYH11	P35749	1972 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229		E9PMD0	336 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	VTN	P04004	478 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	DNM2	P50570	870 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	EMC2	Q15006	297 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	IER5	Q5VY09	327 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	SCLT1	Q96NL6	688 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	MTR	Q99707	1265 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	DNM3	Q9UQ16	869 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	PPME1	Q9Y570	386 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	ACR	P10323	421 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	EPSTI1	Q96J88	318 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	27.77	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	GRB10	Q13322	594 aa		27.77	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		27.77	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	NME8	Q8N427	588 aa		27.77	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	PNMA5	Q96PV4	448 aa		27.77	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	CEP89	Q96ST8	783 aa		27.77	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		27.77	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	TET1	Q8NFU7	2136 aa		27.77	■■■□□ 2.04
GPS1-223	ENST00000584229	CUTA	O60888	179 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	DGAT1	O75907	488 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	RFC2	P35250	354 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	DRP2	Q13474	957 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	USP49	Q70CQ1	688 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	RPAIN	Q86UA6	219 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM143	Q96AN5	459 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	IL23A	Q9NPF7	189 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		27.76	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	EYA4	O95677	639 aa		27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	PLCG1	P19174	1290 aa		27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	HYI	Q5T013	277 aa		27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	PADI6	Q6TGC4	694 aa		27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	SLC26A4	O43511	780 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	CHRNA1	P02708	482 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	GHR	P10912	638 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	KCNK18	Q7Z418	384 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	TCP11	Q8WWU5	503 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	NLRP7	Q8WX94	980 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	GDF15	Q99988	308 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		27.74	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	NBN	O60934	754 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	EPHB4	P54760	987 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	MGAT3	Q09327	533 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	FAM26D	Q5JW98	314 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	NLRP4	Q96MN2	994 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	OSMR	Q99650	979 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GPS1-223	ENST00000584229	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		27.72	■■■□□ 2.03

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