RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578773.1

GGA3-206, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5

Gene GGA3, Length 432 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-206	ENST00000578773	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	WDR81	Q562E7	1941 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	SRF	P11831	508 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	WTAP	Q15007	396 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	NETO1	Q8TDF5	533 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	ZNF558	Q96NG5	402 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	ZBP1	Q9H171	429 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	RGS18	Q9NS28	235 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	SPG21	Q9NZD8	308 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	ADAMTS20	P59510	1910 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GGA3-206	ENST00000578773	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	SHC2	P98077	582 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	LETM2	Q2VYF4	491 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	CABP7	Q86V35	215 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	NELL1	Q92832	810 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	LAMA5	O15230	3695 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	LAMTOR5	O43504	91 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	ATP9A	O75110	1047 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	RAB11FIP3	O75154	756 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	INSRR	P14616	1297 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	CD72	P21854	359 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	HAND2	P61296	217 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	PTPN14	Q15678	1187 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	IER5	Q5VY09	327 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	PCYT2	Q99447	389 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	MAF1	Q9H063	256 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	GINS2	Q9Y248	185 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	DENND3	A2RUS2	1198 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	KRT17	Q04695	432 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	RING1	Q06587	406 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	NEDD9	Q14511	834 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	VPS52	Q8N1B4	723 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	SPINK2	P20155	84 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	STARD6	P59095	220 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	FAM189B	P81408	668 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	KRT76	Q01546	638 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	DSC3	Q14574	896 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	PLCB4	Q15147	1175 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	FAM228A	Q86W67	206 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	NEDD4	P46934	1319 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	NOTCH4	Q99466	2003 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773		M0QZ92	97 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	FIBP	O43427	364 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	RPS6KA5	O75582	802 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	PPM1A	P35813	382 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	HTR4	Q13639	388 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GGA3-206	ENST00000578773	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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