RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	NAT16	Q8N8M0	369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FLCN	Q8NFG4	579 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ATP10A	O60312	1499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	DVL2	O14641	736 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	NPHS1	O60500	1241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	PSPN	O60542	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	LEFTY1	O75610	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	MTHFD2	P13995	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CFP	P27918	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TM4SF4	P48230	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	PDCD1	Q15116	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452		Q8N1Y9	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SP110	Q9HB58	689 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	C7orf72	A4D263	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452		A6NNZ2	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452		H3BML4	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	AMY2A	P04746	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	POU2F2	P09086	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	BMP3	P12645	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SLC5A1	P13866	664 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	TYRP1	P17643	537 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	AMY2B	P19961	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	C5AR1	P21730	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	HAL	P42357	657 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	MTNR1B	P49286	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ALF	Q53S48	1182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	NME9	Q86XW9	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-215	ENST00000566452	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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