RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563597.5

PPP4C-206, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 3

Gene PPP4C, Length 815 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-206	ENST00000563597	STAG3L1	P0CL83	205 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	AAK1	Q2M2I8	961 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	XKR3	Q5GH77	459 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	COG5	Q9UP83	839 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	AKT3	Q9Y243	479 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597		H3BNC9	293 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	NR5A1	Q13285	461 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	PPP2R5C	Q13362	524 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	PTPRO	Q16827	1216 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	OSMR	Q99650	979 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	JAK2	O60674	1132 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	TNFRSF25	Q93038	417 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	VAV3	Q9UKW4	847 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	DENND3	A2RUS2	1198 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	MMP1	P03956	469 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	RB1	P06400	928 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	PSMC5	P62195	406 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	GPM6B	Q13491	265 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	TRIM29	Q14134	588 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	C8orf34	Q49A92	452 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	IL27	Q8NEV9	243 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	STBD1	O95210	358 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	LINC00271	P0C7V0	271 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	CTNNB1	P35222	781 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	BMPR1A	P36894	532 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	FAM228A	Q86W67	206 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	BANK1	Q8NDB2	785 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	HAS1	Q92839	578 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	HLA-C	Q95604	372 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	ADAM2	Q99965	735 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	RGS18	Q9NS28	235 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-206	ENST00000563597	EML1	O00423	815 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	MARCH6	O60337	910 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	MGEA5	O60502	916 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	TFF2	Q03403	129 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	ST3GAL1	Q11201	340 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	MTERF2	Q49AM1	385 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	POTED	Q86YR6	584 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	FAM205C	A6NFA0	338 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	BTBD18	B2RXH4	712 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	GPC3	P51654	580 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	CDC42EP1	Q00587	391 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	CEP89	Q96ST8	783 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	PLVAP	Q9BX97	442 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	TMEM150B	A6NC51	233 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597		C9IYK1	514 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	DNM2	P50570	870 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	ANO5	Q75V66	913 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	SCLT1	Q96NL6	688 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	MUC3A	Q02505	3323 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	DSC3	Q14574	896 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	EPHA7	Q15375	998 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	KIF2C	Q99661	725 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	FOSB	P53539	338 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-206	ENST00000563597	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		27.83	■■■□□ 2.05

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