RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 TBX21Q9UL17 535 aa5.67□□□□□ -1.5
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TMOD3-210ENST00000561408 ZNF521Q96K83 1311 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-210ENST00000561408 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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TMOD3-210ENST00000561408 CDK8P49336 464 aa5.66□□□□□ -1.5
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TMOD3-210ENST00000561408 HERVK_113P62684 666 aa5.66□□□□□ -1.5
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TMOD3-210ENST00000561408 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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TMOD3-210ENST00000561408 TMEM199Q8N511 208 aa5.66□□□□□ -1.5
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TMOD3-210ENST00000561408 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa5.66□□□□□ -1.5
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TMOD3-210ENST00000561408 PROB1E7EW31 1015 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-210ENST00000561408 M0R296 226 aa5.65□□□□□ -1.5
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TMOD3-210ENST00000561408 NUDCQ9Y266 331 aa5.65□□□□□ -1.5
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TMOD3-210ENST00000561408 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF536O15090 1300 aa5.65□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CEP250Q9BV73 2442 aa5.65□□□□□ -1.51
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TMOD3-210ENST00000561408 CNMDO75829 334 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CCL23P55773 120 aa5.64□□□□□ -1.51
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TMOD3-210ENST00000561408 SLC23A3Q6PIS1 610 aa5.64□□□□□ -1.51
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TMOD3-210ENST00000561408 TOX2Q96NM4 488 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 MIPEPQ99797 713 aa5.64□□□□□ -1.51
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TMOD3-210ENST00000561408 MTUS1Q9ULD2 1270 aa5.64□□□□□ -1.51
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TMOD3-210ENST00000561408 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 MYO7AQ13402 2215 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 SIP14410 1827 aa5.63□□□□□ -1.51
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TMOD3-210ENST00000561408 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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TMOD3-210ENST00000561408 RGS3P49796 1198 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 LIG3P49916 1009 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CLCN7P51798 805 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 HHIPL2Q6UWX4 724 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 HID1Q8IV36 788 aa5.63□□□□□ -1.51
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