RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 METTL13Q8N6R0 699 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-227ENST00000551441 RNF169Q8NCN4 708 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-227ENST00000551441 SNX27Q96L92 541 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-227ENST00000551441 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CS-227ENST00000551441 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-227ENST00000551441 RIC8AQ9NPQ8 531 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-227ENST00000551441 ZNF302Q9NR11 478 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-227ENST00000551441 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-227ENST00000551441 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 SMCO2A6NFE2 343 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ZBTB42B2RXF5 422 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 MEIS1O00470 390 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ADAMTS3O15072 1205 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 GPR182O15218 404 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 WEE2P0C1S8 567 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 LIFRP42702 1097 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ADCY7P51828 1080 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 V9GY48 417 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 MYO15AQ9UKN7 3530 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 MYO10Q9HD67 2058 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ST18O60284 1047 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 LAG3P18627 525 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 CLCN3P51790 818 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 PKN1Q16512 942 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ZNF484Q5JVG2 852 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 PLA2G4DQ86XP0 818 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 CASD1Q96PB1 797 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 RNF19AQ9NV58 838 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 TMEM161AQ9NX61 479 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 FAM86B1E9PN63 330 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 DHX15O43143 795 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 GPR32O75388 356 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 C22orf31O95567 290 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 FAM86B2P0C5J1 330 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 FGFR4P22455 802 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 KCNC3Q14003 757 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 DSC3Q14574 896 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 KANK3Q6NY19 840 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 KCNT2Q6UVM3 1135 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 TMC7Q7Z402 723 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 KREMEN2Q8NCW0 462 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 PRRX2Q99811 253 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 MTA3Q9BTC8 594 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 BRPF3Q9ULD4 1205 aa18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 DMDP11532 3685 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 SREBF1P36956 1147 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 SLC26A2P50443 739 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 FAM189BP81408 668 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 RIPOR3Q96MK2 946 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 AKT3Q9Y243 479 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 COL1A2P08123 1366 aa18.3■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 PLXNA3P51805 1871 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 C2CD4DB7Z1M9 353 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 FOSP01100 380 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 PLCB3Q01970 1234 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 RTN1Q16799 776 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ODR4Q5SWX8 454 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 APOA5Q6Q788 366 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 FEZF2Q8TBJ5 459 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ZNF558Q96NG5 402 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 POMKQ9H5K3 350 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 GABBR1Q9UBS5 961 aa18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 BRD1O95696 1058 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ASGR2P07307 311 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 CLK2P49760 499 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.526e-6■■■□□ 15.4
CS-227ENST00000551441 FUT2Q10981 343 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 NECTIN1Q15223 517 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 LONRF3Q496Y0 759 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 CLLU1OSQ5K130 101 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ABI1Q8IZP0 508 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 HELQQ8TDG4 1101 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 AUTS2Q8WXX7 1259 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ZNF577Q9BSK1 485 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ANO2Q9NQ90 1003 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa18.28■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 CDC27P30260 824 aa18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms