RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 UPP2O95045 317 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 BAG4O95429 457 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 P4HBP07237 508 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 QARSP47897 775 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 EPHA7Q15375 998 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 PLA2G4FQ68DD2 849 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 ARNTL2Q8WYA1 636 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 OSMRQ99650 979 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 SH2D3AQ9BRG2 576 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 TMEM60Q9H2L4 133 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 AKT3Q9Y243 479 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 UNC80Q8N2C7 3258 aa19.91■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 RFXAPO00287 272 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 DRP2Q13474 957 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 FAM228AQ86W67 206 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 NOSTRINQ8IVI9 506 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 MAP7D2Q96T17 732 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 LXNQ9BS40 222 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 FTHL17Q9BXU8 183 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 BACH2Q9BYV9 841 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 ADAMTS10Q9H324 1103 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 RGL1Q9NZL6 768 aa19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CS-219ENST00000550655 DDX11L8A8MPP1 907 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 RPS6KA5O75582 802 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 TMOD1P28289 359 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 MCM7P33993 719 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 MCM2P49736 904 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ERVK-21P61565 698 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 C4orf19Q8IY42 314 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 CRIPAKQ8N1N5 446 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 DYDC2Q96IM9 177 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 YME1L1Q96TA2 773 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 SUGCTQ9HAC7 445 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 PCDHA12Q9UN75 941 aa19.89■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 MGEA5O60502 916 aa19.88■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 MAFO75444 373 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ATP2B1P20020 1258 aa19.88■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 GPC3P51654 580 aa19.88■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 CYP26B1Q9NR63 512 aa19.88■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 LPXNO60711 386 aa19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 IGFBP4P22692 258 aa19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 TXKP42681 527 aa19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 NPEPPSP55786 919 aa19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 CYP4A11Q02928 519 aa19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 SLC17A8Q8NDX2 589 aa19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 C17orf80Q9BSJ5 609 aa19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 MTUS1Q9ULD2 1270 aa19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa19.87■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 POTEMA6NI47 508 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 SLITRK3O94933 977 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 LINC00271P0C7V0 271 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 GJB2P29033 226 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 YWHABP31946 246 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 TRAPPC10P48553 1259 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 GRB10Q13322 594 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 NBR1Q14596 966 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 TTC38Q5R3I4 469 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 NPAS4Q8IUM7 802 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ZNF710Q8N1W2 664 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 GDPD5Q8WTR4 605 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 HSD17B14Q9BPX1 270 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 KIF3AQ9Y496 699 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 MTCH2Q9Y6C9 303 aa19.86■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ZBTB39O15060 712 aa19.85■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 GPR182O15218 404 aa19.85■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 DGKIO75912 1065 aa19.85■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 LYPLA2O95372 231 aa19.85■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 DARSP14868 501 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 DSC3Q14574 896 aa19.85■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ZNF174Q15697 407 aa19.85■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 ODR4Q5SWX8 454 aa19.85■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
CS-219ENST00000550655 NEK9Q8TD19 979 aa19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms