RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 LPIN1Q14693 890 aa20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 PTPAQ15257 358 aa20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 XKR9Q5GH70 373 aa20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 KRT79Q5XKE5 535 aa20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 SEPT8Q92599 483 aa20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 NACC1Q96RE7 527 aa20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 AKT3Q9Y243 479 aa20.53■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 SLC26A4O43511 780 aa20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 GPR32O75388 356 aa20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 F13A1P00488 732 aa20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 GHRP10912 638 aa20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 DNM2P50570 870 aa20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 CDC42EP1Q00587 391 aa20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 POTEGQ6S5H5 508 aa20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
COPS7A-216ENST00000543170 PTPRSQ13332 1948 aa20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 DGAT1O75907 488 aa20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 VTNP04004 478 aa20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 IKBKEQ14164 716 aa20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 EMC2Q15006 297 aa20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 HYIQ5T013 277 aa20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 SLC9A7Q96T83 725 aa20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 CLIC4Q9Y696 253 aa20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.51■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ZBBXA8MT70 800 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ZBTB39O15060 712 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 GPC3P51654 580 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 DRP2Q13474 957 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 PKP1Q13835 747 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 TCTN1Q2MV58 587 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ODR4Q5SWX8 454 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 GPR153Q6NV75 609 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 TCP11Q8WWU5 503 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 USP28Q96RU2 1077 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 MTRQ99707 1265 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.5■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 PP2D1A8MPX8 630 aa20.49■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ECM1Q16610 540 aa20.49■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 KIZQ2M2Z5 673 aa20.49■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF410Q86VK4 478 aa20.49■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 OSMRQ99650 979 aa20.49■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 NT5C3AQ9H0P0 336 aa20.49■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.49■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 GBF1Q92538 1859 aa20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 BRD1O95696 1058 aa20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 KCNJ6P48051 423 aa20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 PAK2Q13177 524 aa20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 SLC39A14Q15043 492 aa20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ATL3Q6DD88 541 aa20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 GINS2Q9Y248 185 aa20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ASAP2O43150 1006 aa20.47■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 YEATS4O95619 227 aa20.47■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 CDC25AP30304 524 aa20.47■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 CD52P31358 61 aa20.47■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 MCPH1Q8NEM0 835 aa20.47■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.47■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms