RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 STXBP2Q15833 593 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC35F6Q8N357 371 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 PLXNB2O15031 1838 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ABL1P00519 1130 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 RSPH10BP0C881 870 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 NR2F2P24468 414 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 SP2Q02086 613 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-211ENST00000539589 EPHB6O15197 1021 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM13AO94988 1023 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 MYBP10242 640 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 COPB2P35606 906 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1328Q86T90 577 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC42Q96M95 316 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 MROH8Q9H579 483 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 KCND2Q9NZV8 630 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 MYH11P35749 1972 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 GCNT3O95395 438 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNMA1Q12791 1236 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 UGCGQ16739 394 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 NEK9Q8TD19 979 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 MMP19Q99542 508 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 POLD4Q9HCU8 107 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.26■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 HOXD13P35453 343 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 RRAGAQ7L523 313 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SAMM50Q9Y512 469 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 PASKQ96RG2 1323 aa22.25■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT86O43790 486 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ICAM3P32942 547 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT76Q01546 638 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SPA17Q15506 151 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR78Q5VTH9 848 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 MYCT1Q8N699 235 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 PARVGQ9HBI0 331 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC23Q9UJX2 597 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 NFASCO94856 1347 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 KCTD2Q14681 263 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 GNPTABQ3T906 1256 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC53A6NM62 1247 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR64B1ANS9 1081 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SORBS3O60504 671 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 BAP1Q92560 729 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 CDHR1Q96JP9 859 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP72Q9P209 647 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SFI1A8K8P3 1242 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 JAK3P52333 1124 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 PDXDC1Q6P996 788 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.23■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SFNP31947 248 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.22■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 LYPLA2O95372 231 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 NR3C1P04150 777 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF131P52739 623 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNH2Q12809 1159 aa22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-211ENST00000539589 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms