RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, human

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRJ-206	ENST00000534219	NEK8	Q86SG6	692 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC37A4	O43826	429 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	OXER1	Q8TDS5	423 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	ADAM2	Q99965	735 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	MGEA5	O60502	916 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	LARGE1	O95461	756 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	SEC24B	O95487	1268 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM228A	Q86W67	206 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	BANK1	Q8NDB2	785 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	GTF3C6	Q969F1	213 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PTPRJ-206	ENST00000534219	MARCH6	O60337	910 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	LINC00271	P0C7V0	271 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	MTERF2	Q49AM1	385 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	XKR3	Q5GH77	459 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	SCLT1	Q96NL6	688 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	RGS18	Q9NS28	235 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM20A	Q96MK3	541 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	KRT2	P35908	639 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	GATM	P50440	423 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	TMEM150B	A6NC51	233 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	GRM6	O15303	877 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	CSPG5	O95196	566 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	KCNA5	P22460	613 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	PLVAP	Q9BX97	442 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	MUC3A	Q02505	3323 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	GPC3	P51654	580 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	PSMC5	P62195	406 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	NR5A1	Q13285	461 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	NLRP7	Q8WX94	980 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219		C9IYK1	514 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	EML1	O00423	815 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	DNM2	P50570	870 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	FOSB	P53539	338 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	VAV3	Q9UKW4	847 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	TTC3	P53804	2025 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PTPRJ-206	ENST00000534219	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	JAK2	O60674	1132 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	STBD1	O95210	358 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	PPP2R5C	Q13362	524 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	TRIM29	Q14134	588 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	FAM205C	A6NFA0	338 aa		28	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	TBX3	O15119	743 aa		28	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	28	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	DRP2	Q13474	957 aa		28	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	POTED	Q86YR6	584 aa		28	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	HAS1	Q92839	578 aa		28	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	P2RX5	Q93086	422 aa		28	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		28	■■■□□ 2.07
PTPRJ-206	ENST00000534219	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07

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