RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 CXCL10P02778 98 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 VTNP04004 478 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 P4HBP07237 508 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 PDCP20941 246 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 DNAJB2P25686 324 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 TMOD1P28289 359 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 PBX2P40425 430 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAPPC10P48553 1259 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 CLCN3P51790 818 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 EPHA7Q15375 998 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB30Q15771 203 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 PLA2G4FQ68DD2 849 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 EFCAB12Q6NXP0 572 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 FERMT3Q86UX7 667 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 DBF4BQ8NFT6 615 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 VWCEQ96DN2 955 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC9A7Q96T83 725 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 RGL1Q9NZL6 768 aa12.85□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 ZBTB42B2RXF5 422 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 AMHP03971 560 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 TECP42680 631 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 WDR5P61964 334 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 PAK2Q13177 524 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 CUL4AQ13619 759 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 GPNMBQ14956 572 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 TCTN1Q2MV58 587 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 RASIP1Q5U651 963 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 B3GNT9Q6UX72 402 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 MYOCDQ8IZQ8 938 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 ERMNQ8TAM6 284 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 TIFAQ96CG3 184 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 PBX4Q9BYU1 374 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa12.84□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 ARID2Q68CP9 1835 aa12.83□□□□□ -0.35
UBASH3B-208ENST00000533451 EFCAB14O75071 495 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 UPP2O95045 317 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 CD52P31358 61 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 YWHABP31946 246 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 DNM2P50570 870 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 DEFB103AP81534 67 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 SPIRE1Q08AE8 756 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 LPIN1Q14693 890 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 KIZQ2M2Z5 673 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 RILPL1Q5EBL4 403 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 XKR9Q5GH70 373 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM26DQ5JW98 314 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 FBXO47Q5MNV8 452 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 OTUD6AQ7L8S5 288 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 RPAINQ86UA6 219 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 NME8Q8N427 588 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 APBB2Q92870 758 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 CEP170P1Q96L14 293 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 MTMR9Q96QG7 549 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 MFRPQ9BY79 579 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 OSBPL7Q9BZF2 842 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC28A3Q9HAS3 691 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 PTPRSQ13332 1948 aa12.83□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 TLL1O43897 1013 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 MYOGP15173 224 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 NPEPPSP55786 919 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 MGAT3Q09327 533 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 PTGDRQ13258 359 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 PPP2R2DQ66LE6 453 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 ANO5Q75V66 913 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 HERC6Q8IVU3 1022 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 NEK9Q8TD19 979 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 NLRP7Q8WX94 980 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 SLC7A3Q8WY07 619 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 OSMRQ99650 979 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB34Q9BZG1 259 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 CYP26B1Q9NR63 512 aa12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 LAMA3Q16787 3333 aa12.81□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A087WWV3 80 aa12.81□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 RPS6KA5O75582 802 aa12.81□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 HAUS3Q68CZ6 603 aa12.81□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 GPR153Q6NV75 609 aa12.81□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP12.81□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 RHPN2Q8IUC4 686 aa12.81□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 C4orf19Q8IY42 314 aa12.81□□□□□ -0.36
UBASH3B-208ENST00000533451 FBXO22Q8NEZ5 403 aa12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms