RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 STK24Q9Y6E0 443 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJB2P25686 324 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 NPEPPSP55786 919 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 PDIA5Q14554 519 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 XKR9Q5GH70 373 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 ODR4Q5SWX8 454 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 FERMT3Q86UX7 667 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 LAMA3Q16787 3333 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM265A0A087WTH1 108 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 AMHP03971 560 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 RFC5P40937 340 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 CDC42EP1Q00587 391 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 PAK2Q13177 524 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 DTHD1Q6ZMT9 781 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 STX6O43752 255 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 BMP15O95972 392 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 CD52P31358 61 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 KIZQ2M2Z5 673 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 HERC6Q8IVU3 1022 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 TIFAQ96CG3 184 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 SCLT1Q96NL6 688 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 OSMRQ99650 979 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 FTHL17Q9BXU8 183 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRK-222ENST00000532751 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 GPR32O75388 356 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 MED24O75448 989 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 RPS6KA5O75582 802 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 MUTP22033 750 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 RPA1P27694 616 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 PBX2P40425 430 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 RABGGTBP53611 331 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 DEFB103AP81534 67 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 CATSPER3Q86XQ3 398 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 MYOCDQ8IZQ8 938 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 DEFB123Q8N688 67 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 PADI3Q9ULW8 664 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB39O15060 712 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 GPC3P51654 580 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.514e-7■■□□□ 11.8
PTPRK-222ENST00000532751 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 TCP11Q8WWU5 503 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 NACC1Q96RE7 527 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 MTMR6Q9Y217 621 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 GPR182O15218 404 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 DRP2Q13474 957 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 EMC2Q15006 297 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 KRT79Q5XKE5 535 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 Q7L0L9 218 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 PIGOQ8TEQ8 1089 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 NLRP7Q8WX94 980 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 MTRQ99707 1265 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 TLL1O43897 1013 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 DGAT1O75907 488 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 RESTQ13127 1097 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 GJB5O95377 273 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 RARRES1P49788 294 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 POTEGQ6S5H5 508 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF410Q86VK4 478 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PTPRK-222ENST00000532751 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
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