RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
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PUF60-218ENST00000531995 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PUF60-218ENST00000531995 DISC1Q9NRI5 854 aa20.9■□□□□ 0.94
PUF60-218ENST00000531995 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.9■□□□□ 0.94
PUF60-218ENST00000531995 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa20.9■□□□□ 0.94
PUF60-218ENST00000531995 C5orf42Q9H799 3197 aa20.9■□□□□ 0.94
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PUF60-218ENST00000531995 WDR64B1ANS9 1081 aa20.89■□□□□ 0.93
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PUF60-218ENST00000531995 CSPG5O95196 566 aa20.89■□□□□ 0.93
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PUF60-218ENST00000531995 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 MGAT3Q09327 533 aa20.89■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 LPIN1Q14693 890 aa20.89■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.89■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.89■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.89■□□□□ 0.93
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PUF60-218ENST00000531995 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.89■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.89■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 PCDHA12Q9UN75 941 aa20.89■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 BRD1O95696 1058 aa20.88■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 F13A1P00488 732 aa20.88■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 SFNP31947 248 aa20.88■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 CTNNB1P35222 781 aa20.88■□□□□ 0.93
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PUF60-218ENST00000531995 TMEM192Q8IY95 271 aa20.88■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 RDM1Q8NG50 284 aa20.88■□□□□ 0.93
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PUF60-218ENST00000531995 SAMD11Q96NU1 681 aa20.88■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.88■□□□□ 0.93
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PUF60-218ENST00000531995 CLIC4Q9Y696 253 aa20.88■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 MYO7AQ13402 2215 aa20.88■□□□□ 0.93
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PUF60-218ENST00000531995 ZNF862O60290 1169 aa20.87■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 MARCH6O60337 910 aa20.87■□□□□ 0.93
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PUF60-218ENST00000531995 BANK1Q8NDB2 785 aa20.85■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
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PUF60-218ENST00000531995 AZI2Q9H6S1 392 aa20.85■□□□□ 0.93
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PUF60-218ENST00000531995 PRPHP41219 470 aa20.84■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.84■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.84■□□□□ 0.93
PUF60-218ENST00000531995 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.84■□□□□ 0.93
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PUF60-218ENST00000531995 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.84■□□□□ 0.93
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