RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525059.1

PTDSS2-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS2, Length 1,258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-202ENST00000525059 ASB2Q96Q27 587 aa22.93■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.93■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.93■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 GINS2Q9Y248 185 aa22.93■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 EVPLQ92817 2033 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 WDR81Q562E7 1941 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 H3BNC9 293 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 EML1O00423 815 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 VTNP04004 478 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 STAG3L1P0CL83 205 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 CLCN3P51790 818 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 PSMC5P62195 406 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 MAP7D2Q96T17 732 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 RGS18Q9NS28 235 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.92■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 BTBD18B2RXH4 712 aa22.91■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 RB1P06400 928 aa22.91■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 CDC42EP1Q00587 391 aa22.91■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.91■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.91■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 OSMRQ99650 979 aa22.91■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.91■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 COG5Q9UP83 839 aa22.91■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 FAM205CA6NFA0 338 aa22.9■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 BMPR1AP36894 532 aa22.9■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 TRIM29Q14134 588 aa22.9■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 FAM228AQ86W67 206 aa22.9■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.9■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 AKT3Q9Y243 479 aa22.9■■□□□ 1.26
PTDSS2-202ENST00000525059 C9IYK1 514 aa22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 MGEA5O60502 916 aa22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 FAM189BP81408 668 aa22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 DSC3Q14574 896 aa22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 EPHA7Q15375 998 aa22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 ANO5Q75V66 913 aa22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 POTEDQ86YR6 584 aa22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 IL27Q8NEV9 243 aa22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 ADAM2Q99965 735 aa22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 GPC3P51654 580 aa22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 GPM6BQ13491 265 aa22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 PTPROQ16827 1216 aa22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 AAK1Q2M2I8 961 aa22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 BANK1Q8NDB2 785 aa22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 PLVAPQ9BX97 442 aa22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 PPME1Q9Y570 386 aa22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 VCANP13611 3396 aa22.88■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 MTERF2Q49AM1 385 aa22.87■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.87■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 C4orf19Q8IY42 314 aa22.87■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 TTC28Q96AY4 2481 aa22.86■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 DENND3A2RUS2 1198 aa22.86■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 TMEM150BA6NC51 233 aa22.86■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 MARCH6O60337 910 aa22.86■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 DNM2P50570 870 aa22.86■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 HLA-CQ95604 372 aa22.86■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.86■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.86■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 REV3LO60673 3130 aa22.85■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 BMP1P13497 986 aa22.85■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 CTNNB1P35222 781 aa22.85■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 DRP2Q13474 957 aa22.85■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.85■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.85■■□□□ 1.25
PTDSS2-202ENST00000525059 P2RX5Q93086 422 aa22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms