RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519004.5

PABPC1-208, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PABPC1, Length 2,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-208ENST00000519004 C5P01031 1676 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 ETS2P15036 469 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 MCM7P33993 719 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 STK4Q13043 487 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 GIT2Q14161 759 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 WTAPQ15007 396 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 MAN2A1Q16706 1144 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 DUPD1Q68J44 220 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 VSTM1Q6UX27 236 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 LRRC15Q8TF66 581 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.65□□□□□ -0.06
PABPC1-208ENST00000519004 MYH4Q9Y623 1939 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 TMEM120BA0PK00 339 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 RAPGEF3O95398 923 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ASLP04424 464 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 RTP1P59025 263 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CBX3Q13185 183 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CROCCP2Q86T23 111 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ERP27Q96DN0 273 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 HIC2Q96JB3 615 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 EYA4O95677 639 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 T-ENOLP0DO92 83 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CREB1P16220 341 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 LIN52Q52LA3 116 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SOGA3Q5TF21 947 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 MFSD5Q6N075 450 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 VSIG1Q86XK7 387 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SEMA4AQ9H3S1 761 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.64□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 LYNP07948 512 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 FCER1AP12319 257 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 MTFR1Q15390 333 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 GSTA3Q16772 222 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 NR2E1Q9Y466 385 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 PP2D1A8MPX8 630 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 RASGRF2O14827 1237 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ITGA2BP08514 1039 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 RCAN1P53805 252 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 PDE4DQ08499 809 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CCDC6Q16204 474 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SMYD1Q8NB12 490 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CUEDC2Q9H467 287 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CHKBQ9Y259 395 aa14.63□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CIAO1O76071 339 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 NOL4O94818 638 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ZCCHC18P0CG32 403 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 PLTPP55058 493 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 FUT2Q10981 343 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 RCN1Q15293 331 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 P3H1Q32P28 736 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 BARGINQ6ZT62 677 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 DAAM2Q86T65 1068 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 GDAP1Q8TB36 358 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms