RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	VCPKMT	Q9H867	229 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	C6orf50	Q9HD87	102 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CASZ1	Q86V15	1759 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A087X0T9	212 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MYO1F	O00160	1098 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAPPC3	O43617	180 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	BUB1	O43683	1085 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA0754	O94854	1291 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF4A	O95239	1232 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GNA14	O95837	355 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT14	P02533	472 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM228B	P0C875	321 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TIMP2	P16035	220 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KLRC1	P26715	233 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TM4SF1	P30408	202 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	HSD17B3	P37058	310 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	USP8	P40818	1118 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GUCY2F	P51841	1108 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TNNC1	P63316	161 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	COASY	Q13057	564 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	BIRC3	Q13489	604 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC41	Q15345	812 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GRIK5	Q16478	980 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CALCRL	Q16602	461 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ECM1	Q16610	540 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KCTD16	Q68DU8	428 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RPAIN	Q86UA6	219 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	OGFOD1	Q8N543	542 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	IFT81	Q8WYA0	676 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	HAS1	Q92839	578 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CABS1	Q96KC9	395 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RUFY1	Q96T51	708 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CPVL	Q9H3G5	476 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM260	Q9NX78	707 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PLAA	Q9Y263	795 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	C21orf2	O43822	256 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DGAT1	O75907	488 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TDP2	O95551	362 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TSPY3	P0CV98	308 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TSPY8	P0CW00	308 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SNHG28	P0DPA3	235 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	DRD4	P21917	467 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	PRKCI	P41743	596 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	TXK	P42681	527 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CDK8	P49336	464 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ADCY7	P51828	1080 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SEC24C	P53992	1094 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GTF2I	P78347	998 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CLDN10	P78369	228 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	GSTO1	P78417	241 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	CBLB	Q13191	982 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	LAPTM4A	Q15012	233 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	RPS6KA1	Q15418	735 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	ASIC2	Q16515	512 aa		5.43	□□□□□ -1.54
ATXN3-212	ENST00000515746	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		5.43	□□□□□ -1.54

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