RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 SIPA1L1O43166 1804 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 DENND3A2RUS2 1198 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRIQ4A6NIV6 560 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 STAM2O75886 525 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 ACTN1P12814 892 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 PRKCEQ02156 737 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 DPYDQ12882 1025 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 PTK7Q13308 1070 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC62Q6P9F0 684 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 DYDC2Q96IM9 177 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.31□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 ATAD5Q96QE3 1844 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 FGFR4P22455 802 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 USP11P51784 963 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 SHHQ15465 462 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 NFRKBQ6P4R8 1299 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 ABI1Q8IZP0 508 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM143Q96AN5 459 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 OSMRQ99650 979 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 PHF24Q9UPV7 400 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM43BA6NCK2 446 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 ZBTB39O15060 712 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 MAFGO15525 162 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 FBXO45P0C2W1 286 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 SYT1P21579 422 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 TXLNAP40222 546 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 RABGGTBP53611 331 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 FAAP100Q0VG06 881 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 EFCAB12Q6NXP0 572 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 KIF2CQ99661 725 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 AGXT2Q9BYV1 514 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa7.3□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 STX6O43752 255 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 Q7L0L9 218 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 LRCH3Q96II8 777 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 YME1L1Q96TA2 773 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 LXNQ9BS40 222 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 PP2D1A8MPX8 630 aa7.29□□□□□ -1.24
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RRN3P1-201ENST00000514813 CCNE2O96020 404 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 OR52Z1P0C646 297 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNA2P16389 499 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 EDNRBP24530 442 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF618Q5T7W0 954 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 IER5Q5VY09 327 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 STAMQ92783 540 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 ESYT2A0FGR8 921 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 RPS6KA5O75582 802 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 MYBP10242 640 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 QARSP47897 775 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 KSR1Q8IVT5 923 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 KLHDC9Q8NEP7 349 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 BICD1Q96G01 975 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 CALML4Q96GE6 196 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM60Q9H2L4 133 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 SEPT3Q9UH03 358 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 SFI1A8K8P3 1242 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 TLL1O43897 1013 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 HBP1O60381 514 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3P1-201ENST00000514813 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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