RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 ALKQ9UM73 1620 aa7□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 KDM5CP41229 1560 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 GSTA4O15217 222 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 AOAHP28039 575 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 CRY1Q16526 586 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 SPRED1Q7Z699 444 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 ABCA6Q8N139 1617 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 CUTAO60888 179 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 EFCAB14O75071 495 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 PTGS1P23219 599 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 TM4SF20Q53R12 229 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 Q8TCH9 128 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 WNK4Q96J92 1243 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 AMNQ9BXJ7 453 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 KLC2Q9H0B6 622 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 GALNT8Q9NY28 637 aa6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 MROH2AA6NES4 1674 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 KRT15P19012 456 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 ST5P78524 1137 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 IL13RA1P78552 427 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 SOGA3Q5TF21 947 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 SRRDQ9UH36 339 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 PRXQ9BXM0 1461 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 TNRQ92752 1358 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 SAMD9Q5K651 1589 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4D-217ENST00000509355 FAM135BQ49AJ0 1406 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ESYT3A0FGR9 886 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 KCNK3O14649 394 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF623O75123 536 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 RASGRP1O95267 797 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 PALM2Q8IXS6 379 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 LILRB2Q8N423 598 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 DLG3Q92796 817 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 INCENPQ9NQS7 918 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 CLIP1P30622 1438 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 FOXS1O43638 330 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ETV4P43268 484 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 DNM2P50570 870 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 KANK2Q63ZY3 851 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 GNRHR2Q96P88 292 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 JCADQ9P266 1359 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 RASSF10A6NK89 507 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 C6P13671 934 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 MC4RP32245 332 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 DUSP8Q13202 625 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 RNF151Q2KHN1 245 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 C2orf27AQ580R0 203 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 LMF1Q96S06 567 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4D-217ENST00000509355 BTBD2Q9BX70 525 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms