RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	EVPL	Q92817	2033 aa		13.78	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	XKR3	Q5GH77	459 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	PPME1	Q9Y570	386 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	HOXA2	O43364	376 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	CHMP2A	O43633	222 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF862	O60290	1169 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	JAK2	O60674	1132 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	GPR32	O75388	356 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	TDP2	O95551	362 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	DNM2	P50570	870 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	TFF2	Q03403	129 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	LETM2	Q2VYF4	491 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	VCAN	P13611	3396 aa		13.76	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	LINC00271	P0C7V0	271 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	KRT2	P35908	639 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	PSMC5	P62195	406 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	PPP2R5C	Q13362	524 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	INF2	Q27J81	1249 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	UIMC1	Q96RL1	719 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	OSMR	Q99650	979 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	ADAM2	Q99965	735 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	TTC28	Q96AY4	2481 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464		C9IYK1	514 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	ST18	O60284	1047 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	MMP1	P03956	469 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	VTN	P04004	478 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	CLCN3	P51790	818 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	TRIM29	Q14134	588 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	REV3L	O60673	3130 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	MARCH6	O60337	910 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	GPC3	P51654	580 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNQ1	P51787	676 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM189B	P81408	668 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	UBE3A	Q05086	875 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC3-208	ENST00000506464	UGCG	Q16739	394 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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