RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 ZMYM6O95789 1325 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 SHANK3Q9BYB0 1731 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 PEAK1Q9H792 1746 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 HSF2BPO75031 334 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 RECKO95980 971 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 ATP1A3P13637 1013 aa4.3□□□□□ -1.72
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ANKRD28-213ENST00000498524 ZAP70P43403 619 aa4.3□□□□□ -1.72
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ANKRD28-213ENST00000498524 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.3□□□□□ -1.72
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ANKRD28-213ENST00000498524 FAM114A1Q8IWE2 563 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 DESI2Q9BSY9 194 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 PIF1Q9H611 641 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 KCND1Q9NSA2 647 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.3□□□□□ -1.72
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ANKRD28-213ENST00000498524 PHF24Q9UPV7 400 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
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ANKRD28-213ENST00000498524 CACNA1FO60840 1977 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 C17orf102A2RUQ5 167 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 MAGEA9P43362 315 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 ACLYP53396 1101 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 TIMM10P62072 90 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 CAP1Q01518 475 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 GPM6BQ13491 265 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 TRIM60Q495X7 471 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 CEP68Q76N32 757 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 TLK2Q86UE8 772 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 CASP10Q92851 521 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 IWS1Q96ST2 819 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 RAB34Q9BZG1 259 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 TLE6Q9H808 572 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 ST7Q9NRC1 585 aa4.29□□□□□ -1.72
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ANKRD28-213ENST00000498524 SAMM50Q9Y512 469 aa4.29□□□□□ -1.72
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ANKRD28-213ENST00000498524 TNKSO95271 1327 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 MBD4O95243 580 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 STX17P56962 302 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 PFKPQ01813 784 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 ITGA7Q13683 1181 aa4.29□□□□□ -1.72
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ANKRD28-213ENST00000498524 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 UBE3CQ15386 1083 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 SYDE2Q5VT97 1194 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 LZTS1Q9Y250 596 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 PSMA7O14818 248 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 KIAA0355O15063 1070 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 GPAA1O43292 621 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 TACC1O75410 805 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 DEXIO95424 95 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 LAG3P18627 525 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 PHKA1P46020 1223 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 NRLP54845 237 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC20A2Q08357 652 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 ST3GAL1Q11201 340 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 KIF5AQ12840 1032 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 TFDP1Q14186 410 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 LRRC41Q15345 812 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 TOMM20Q15388 145 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 CCDC122Q5T0U0 273 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 NDUFAF2Q8N183 169 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 IQUBQ8NA54 791 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 PANX2Q96RD6 677 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 NELL2Q99435 816 aa4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
ANKRD28-213ENST00000498524 INTUQ9ULD6 942 aa4.29□□□□□ -1.72
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