RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 BTBD7Q9P203 1132 aa5.71□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.71□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF839A8K0R7 811 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 C8BP07358 591 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 GPR3P46089 330 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 RGS3P49796 1198 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ADCY2Q08462 1091 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PKN1Q16512 942 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 TOR2AQ5JU69 321 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CHPFQ8IZ52 775 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC136Q96JN2 1154 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 RNF38Q9H0F5 515 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 GALNT8Q9NY28 637 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 FANCD2Q9BXW9 1451 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PRSS38A1L453 326 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 KLHL33A6NCF5 533 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PCDH8O95206 1070 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 LPLP06858 475 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ATF2P15336 505 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ENPP1P22413 925 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ECE1P42892 770 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CDR1P51861 262 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MESP2Q0VG99 397 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 INAVAQ3KP66 663 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MZB1Q8WU39 189 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 KCNN1Q92952 543 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM209Q96SK2 561 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 FOXB1Q99853 325 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 AMNQ9BXJ7 453 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CROTQ9UKG9 612 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 INVSQ9Y283 1065 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 E2F8A0AVK6 867 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 TSPAN6O43657 245 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PEX10O60683 326 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 SCGB1D2O95969 90 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PRLP01236 227 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 RBP3P10745 1247 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 EPHB3P54753 998 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MYBPC3Q14896 1274 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA1841Q6NSI8 718 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PROSER1Q86XN7 944 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 STPG3Q8N7X2 389 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CLIC6Q96NY7 704 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 SLC38A3Q99624 504 aa5.68□□□□□ -1.5
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POLR1B-215ENST00000498054 DLL4Q9NR61 685 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 HSPBP1Q9NZL4 362 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 USP18Q9UMW8 372 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 WASF3Q9UPY6 502 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 WIZO95785 1651 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CFTRP13569 1480 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MPIG6BO95866 241 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 OSMP13725 252 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 FBLN1P23142 703 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 LIMS1P48059 325 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 LGALS4P56470 323 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 FOXO4P98177 505 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PPM1NQ8N819 430 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 FAM84AQ96KN4 292 aa5.67□□□□□ -1.5
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