RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, humanhuman

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1-218ENST00000495588 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 TEPSINQ96N21 525 aa6.7□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.7□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.7□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.7□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 CACNA1SQ13698 1873 aa6.7□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 DLEC1Q9Y238 1755 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF609O15014 1411 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 H0YIN7 160 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 HRKO00198 91 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 PSPNO60542 156 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 TAF5LO75529 589 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 UBOX5O94941 541 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 NPR1P16066 1061 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 CHRNDQ07001 517 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 PPP2R5EQ16537 467 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 METTL24Q5JXM2 366 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 MASTLQ96GX5 879 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 A0A0G2JLW4 131 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 SNAP23O00161 211 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 PDPK1O15530 556 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 GJB6O95452 261 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 DPEP1P16444 411 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 GALK1P51570 392 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 NCAPHQ15003 741 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 STYK1Q6J9G0 422 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 AACSQ86V21 672 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 JMYQ8N9B5 988 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 SHISA4Q96DD7 197 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 SPON1Q9HCB6 807 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 SLX4Q8IY92 1834 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 MROH5Q6ZUA9 1318 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 A0A1B0GUL7 405 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 N4BP3O15049 544 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 BBOX1O75936 387 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 PDE8BO95263 885 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 KCNA3P22001 575 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ADORA1P30542 326 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ALDH1B1P30837 517 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 TIMM10P62072 90 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 EFEMP1Q12805 493 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ATP2B3Q16720 1220 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 OLFM4Q6UX06 510 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 TMEM192Q8IY95 271 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 VWCEQ96DN2 955 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 NEUROD6Q96NK8 337 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 GPR108Q9NPR9 543 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 LTBP1Q14766 1721 aa6.67□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ADAMTS20P59510 1910 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 MX1P20591 662 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 FGFR2P21802 821 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 KLRK1P26718 216 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 PDE1AP54750 535 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 EPHB3P54753 998 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 TGFB2P61812 414 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 GPSM2P81274 684 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 PLP2Q04941 152 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 VMACQ2NL98 169 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 BBS9Q3SYG4 887 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.66□□□□□ -1.34
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