RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	CYP11B2	P19099	503 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CIITA	P33076	1130 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT9	P35527	623 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	SREBF1	P36956	1147 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	PSMC4	P43686	418 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	USP11	P51784	963 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	GNG11	P61952	73 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP4	P98171	946 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	SPAG1	Q07617	926 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	KIF22	Q14807	665 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730		Q4G0T1	1027 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR78	Q5VTH9	848 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	FBXO11	Q86XK2	927 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CPXCR1	Q8N123	301 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC35F6	Q8N357	371 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	ATG4C	Q96DT6	458 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAJC7	Q99615	494 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	BTBD7	Q9P203	1132 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	FEM1B	Q9UK73	627 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	VAV3	Q9UKW4	847 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		6.44	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	RLF	Q13129	1914 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	VWA5A	O00534	786 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB39	O15060	712 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	ZSCAN12	O43309	604 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CYP3A4	P08684	503 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	PLA2G4B	P0C869	781 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	RSPH10B	P0C881	870 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	BCR	P11274	1271 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	IDE	P14735	1019 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	ERCC3	P19447	782 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CTGF	P29279	349 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CASQ1	P31415	396 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CASP5	P51878	434 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC12A3	P55017	1021 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	UBXN2A	P68543	259 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CAP1	Q01518	475 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	APBA1	Q02410	837 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	SEMA3F	Q13275	785 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	GIT2	Q14161	759 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGEF6	Q15052	776 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	MEA1	Q16626	185 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR16	Q569H4	304 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT79	Q5XKE5	535 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC174	Q6PII3	467 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	LBX2	Q6XYB7	198 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	GPBP1	Q86WP2	473 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC51	Q96ER9	411 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP7D2	Q96T17	732 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	AMN	Q9BXJ7	453 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	EFCC1	Q9HA90	598 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	COL20A1	Q9P218	1284 aa		6.43	□□□□□ -1.38
C4BPB-208	ENST00000492730	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38

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