RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491530.5

CHTF18-211, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 819 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-211ENST00000491530 PPP2R2DQ66LE6 453 aa17.25■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 HAUS3Q68CZ6 603 aa17.25■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 NFRKBQ6P4R8 1299 aa17.25■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 POTEGQ6S5H5 508 aa17.25■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 CLEC17AQ6ZS10 378 aa17.25■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 ANO5Q75V66 913 aa17.25■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 CABP7Q86V35 215 aa17.25■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 SESTD1Q86VW0 696 aa17.25■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 LRRC15Q8TF66 581 aa17.25■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 CCSER1Q9C0I3 900 aa17.25■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 HBP1O60381 514 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 INSRRP14616 1297 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 MUTP22033 750 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 ADAM17P78536 824 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 TMEM119Q4V9L6 283 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 XKR3Q5GH77 459 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 KCNK18Q7Z418 384 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 CKAP2LQ8IYA6 745 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 MICALL1Q8N3F8 863 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 CTAGE1Q96RT6 745 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 CEP89Q96ST8 783 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 THEGQ9P2T0 379 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 TRPC6Q9Y210 931 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 STK24Q9Y6E0 443 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 TET1Q8NFU7 2136 aa17.24■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 A0A087X0B3 334 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 DDX11L8A8MPP1 907 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 YWHABP31946 246 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 UBA7P41226 1012 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 PPFIA1Q13136 1202 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 KARSQ15046 597 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 GRIK4Q16099 956 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 MARCH8Q5T0T0 291 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 RESP18Q5W5W9 173 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 PLA2G4FQ68DD2 849 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 ADALQ6DHV7 355 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 C7orf31Q8N865 590 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 PIGOQ8TEQ8 1089 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 LMBR1Q8WVP7 490 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 FAM167AQ96KS9 214 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 SH2D3AQ9BRG2 576 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 SETD4Q9NVD3 440 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 KIAA1024Q9UPX6 916 aa17.23■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 NRCAMQ92823 1304 aa17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 CHD7Q9P2D1 2997 aa17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 TNFRSF10AO00220 468 aa17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 SLC26A4O43511 780 aa17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 NPEPPSP55786 919 aa17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 TMEM87AQ8NBN3 555 aa17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 VWCEQ96DN2 955 aa17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 ZBTB10Q96DT7 871 aa17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 PLIN2Q99541 437 aa17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 NRBP2Q9NSY0 501 aa17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 COL1A2P08123 1366 aa17.22■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 SIP14410 1827 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 C17orf102A2RUQ5 167 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 PLCG1P19174 1290 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 RARRES1P49788 294 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 MTERF2Q49AM1 385 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF484Q5JVG2 852 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 ASB2Q96Q27 587 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 NACC1Q96RE7 527 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 ANKEF1Q9NU02 776 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 NOD1Q9Y239 953 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa17.21■□□□□ 0.35
CHTF18-211ENST00000491530 MYH11P35749 1972 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 RRN3P2A6NIE6 340 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 E9PMD0 336 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 TREHO43280 583 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 PFKMP08237 780 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 ACTN1P12814 892 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP17.2■□□□□ 0.341e-9■□□□□ 10.6
CHTF18-211ENST00000491530 CMA1P23946 247 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 IGBP1P78318 339 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 NAALADL2Q58DX5 795 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 RETREG2Q8NC44 543 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 CALML4Q96GE6 196 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 NT5C3AQ9H0P0 336 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 CERS4Q9HA82 394 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 CYP26B1Q9NR63 512 aa17.2■□□□□ 0.34
CHTF18-211ENST00000491530 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms