RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ORAI2Q96SN7 254 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ANO3Q9BYT9 981 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 OR10A5Q9H207 317 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 IRAK3Q9Y616 596 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 TNKSO95271 1327 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 DBX1A6NMT0 343 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 MAFGO15525 162 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 MT-CO1P00395 513 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 RBP3P10745 1247 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 BCAR1P56945 870 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 KRT85P78386 507 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 MCL1Q07820 350 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 STILQ15468 1287 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 STK32CQ86UX6 486 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 TOX2Q96NM4 488 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 NOX5Q96PH1 765 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-204ENST00000489160 PRSS38A1L453 326 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 RFXAPO00287 272 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 IL18BPO95998 194 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CHGBP05060 677 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 IL13RA1P78552 427 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 HTRA3P83110 453 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 NFATC3Q12968 1075 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 UGT8Q16880 541 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 ZNF385BQ569K4 471 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 STPG3Q8N7X2 389 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 KCND1Q9NSA2 647 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 MKS1Q9NXB0 559 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 EID1Q9Y6B2 187 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 E2F8A0AVK6 867 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 FZD9O00144 591 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CCND1P24385 295 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 LINC00310P59036 64 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 RTP5Q14D33 572 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CT83Q5H943 113 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PHF19Q5T6S3 580 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 KANK2Q63ZY3 851 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 HOOK2Q96ED9 719 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 RAX2Q96IS3 184 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 CROTQ9UKG9 612 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 KCTD3Q9Y597 815 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 MYPNQ86TC9 1320 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PFKMP08237 780 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 MTHFD2P13995 350 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 RAB27AP51159 221 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 MAP3K12Q12852 859 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 FAM129CQ86XR2 697 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 MTG2Q9H4K7 406 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 MARCH6O60337 910 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL20-204ENST00000489160 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
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