RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 PDCP20941 246 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 TECP42680 631 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 PAK2Q13177 524 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 KIZQ2M2Z5 673 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 CEP89Q96ST8 783 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 ZNF576Q9H609 170 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 TRANK1O15050 2925 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 TLL1O43897 1013 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 SLITRK3O94933 977 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 SNX21Q969T3 373 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 CEP170P1Q96L14 293 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 OSMRQ99650 979 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 MYO9BQ13459 2157 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 COL6A3P12111 3177 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 GJB5O95377 273 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 HSCBQ8IWL3 235 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 PADI3Q9ULW8 664 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 PPME1Q9Y570 386 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 TTC3P53804 2025 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-208ENST00000481121 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 RPS6KA5O75582 802 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 CA3P07451 260 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 DNM2P50570 870 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 NPEPPSP55786 919 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 PTGDRQ13258 359 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 ERMNQ8TAM6 284 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 SCLT1Q96NL6 688 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 GUCD1Q96NT3 240 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 LAD1O00515 517 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 GPR32O75388 356 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 DRP2Q13474 957 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 XKR9Q5GH70 373 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.25■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 LYPLA2O95372 231 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 RFC5P40937 340 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.312e-6■■■■□ 25.2
NELFE-208ENST00000481121 GPC3P51654 580 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 ODR4Q5SWX8 454 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 COL4A6Q14031 1691 aa23.24■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 BRAPQ7Z569 592 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 RAD9AQ99638 391 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 RAB34Q9BZG1 259 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 EYSQ5T1H1 3165 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB39O15060 712 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 GPR182O15218 404 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 UPP2O95045 317 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 NLRP7Q8WX94 980 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 TOP1MTQ969P6 601 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 MED24O75448 989 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 PRPHP41219 470 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 CDC42EP1Q00587 391 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 GRIN2CQ14957 1233 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 EMC2Q15006 297 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 FERMT3Q86UX7 667 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 FAM228AQ86W67 206 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.22■■□□□ 1.31
NELFE-208ENST00000481121 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
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