RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TMOD1P28289 359 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 KIZQ2M2Z5 673 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 NEK9Q8TD19 979 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 GUCD1Q96NT3 240 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 MAP7D2Q96T17 732 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 ZNF576Q9H609 170 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 PADI3Q9ULW8 664 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 AKT3Q9Y243 479 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 GINS2Q9Y248 185 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-211ENST00000480301 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 PTGDRQ13258 359 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 DRP2Q13474 957 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 CEP170P1Q96L14 293 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 PTPRSQ13332 1948 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 GJB5O95377 273 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 AMHP03971 560 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 OSMRQ99650 979 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 PPME1Q9Y570 386 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 ENPP3O14638 875 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 PDCP20941 246 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 GPC3P51654 580 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 PAK2Q13177 524 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 TOP1MTQ969P6 601 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 TLL1O43897 1013 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 MED24O75448 989 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 RPS6KA5O75582 802 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 CA3P07451 260 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 GRIN2CQ14957 1233 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 XKR9Q5GH70 373 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 TMX1Q9H3N1 280 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 GBF1Q92538 1859 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 A0A087WWV3 80 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 LAD1O00515 517 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF15O94989 841 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 SYT1P21579 422 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 DNM2P50570 870 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 PDIA5Q14554 519 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 IL17AQ16552 155 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 FAM228AQ86W67 206 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 RAD9AQ99638 391 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.344e-22■□□□□ 8.8
ACTB-211ENST00000480301 RFC5P40937 340 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 PRPHP41219 470 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 BRAPQ7Z569 592 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 FERMT3Q86UX7 667 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 HSCBQ8IWL3 235 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 ERMNQ8TAM6 284 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.4■■□□□ 1.34
ACTB-211ENST00000480301 LCHNA4D1U4 455 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 GPR182O15218 404 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 RPA1P27694 616 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 CDC42EP1Q00587 391 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 UPP2O95045 317 aa23.38■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ACTB-211ENST00000480301 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
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