RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-207ENST00000475060 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.15□□□□□ -1.26
CTPS1-207ENST00000475060 LRRC37A2A6NM11 1700 aa7.15□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 RSPH10B2B2RC85 870 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 STAM2O75886 525 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 NFASCO94856 1347 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 FAM13AO94988 1023 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 RSPH10BP0C881 870 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 FERP16591 822 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 ABCD1P33897 745 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 RARRES1P49788 294 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 NCKAP1LP55160 1127 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 SNAP25P60880 206 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 CBX1P83916 185 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 GTF2BQ00403 316 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 KRT76Q01546 638 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 CYP27A1Q02318 531 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 CYP4A11Q02928 519 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 TERF2Q15554 542 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 TKFCQ3LXA3 575 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 DCAF15Q66K64 600 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 SLC30A5Q8TAD4 765 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 JDP2Q8WYK2 163 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 GPRASP2Q96D09 838 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 EEF2KMTQ96G04 330 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 IWS1Q96ST2 819 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 MMS19Q96T76 1030 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 TLR10Q9BXR5 811 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 MTFR1LQ9H019 292 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 AS3MTQ9HBK9 375 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 VEZTQ9HBM0 779 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 RGL1Q9NZL6 768 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 CCPG1Q9ULG6 757 aa7.14□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 NCANO14594 1321 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 A0A087X0T9 212 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 C19orf81C9J6K1 198 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 NFIBO00712 420 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 GCNT3O95395 438 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 FAM228BP0C875 321 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 VCAM1P19320 739 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 POLD1P28340 1107 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 QARSP47897 775 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 FMO5P49326 533 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 BACE1P56817 501 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 VSNL1P62760 191 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 PGM5Q15124 567 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 ASIC2Q16515 512 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 MAP9Q49MG5 647 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 CCDC174Q6PII3 467 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 HDXQ7Z353 690 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 LMO3Q8TAP4 145 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
CTPS1-207ENST00000475060 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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