RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469223.5

HDAC6-217, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC6, Length 796 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-217ENST00000469223 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 CABP7Q86V35 215 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 LRRC43Q8N309 656 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 TTC14Q96N46 770 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 SLC30A4O14863 429 aa14.56□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 HAND2P61296 217 aa14.56□□□□□ -0.08
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HDAC6-217ENST00000469223 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.56□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 GPR149Q86SP6 731 aa14.56□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.56□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.56□□□□□ -0.08
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HDAC6-217ENST00000469223 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.56□□□□□ -0.08
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HDAC6-217ENST00000469223 RGS18Q9NS28 235 aa14.56□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.56□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.56□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 GINS2Q9Y248 185 aa14.56□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.56□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.56□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.56□□□□□ -0.08
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HDAC6-217ENST00000469223 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 KRT76Q01546 638 aa14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 LETM2Q2VYF4 491 aa14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 NETO1Q8TDF5 533 aa14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 CASD1Q96PB1 797 aa14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 RNF19AQ9NV58 838 aa14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 LAMA1P25391 3075 aa14.54□□□□□ -0.08
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HDAC6-217ENST00000469223 LAMTOR5O43504 91 aa14.54□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 RPS6KA5O75582 802 aa14.54□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 CXCL14O95715 111 aa14.54□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 POLR2MP0CAP2 368 aa14.54□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 INSRRP14616 1297 aa14.54□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
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HDAC6-217ENST00000469223 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.54□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 ZBP1Q9H171 429 aa14.54□□□□□ -0.08
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HDAC6-217ENST00000469223 NEDD4P46934 1319 aa14.54□□□□□ -0.08
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HDAC6-217ENST00000469223 LOC400499M0QZD8 3231 aa14.53□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.53□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.53□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 STAM2O75886 525 aa14.53□□□□□ -0.08
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HDAC6-217ENST00000469223 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 SPEM2Q0P670 501 aa14.53□□□□□ -0.08
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HDAC6-217ENST00000469223 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.53□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.53□□□□□ -0.08
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HDAC6-217ENST00000469223 KAT14Q9H8E8 782 aa14.53□□□□□ -0.08
HDAC6-217ENST00000469223 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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HDAC6-217ENST00000469223 PMLP29590 882 aa14.52□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
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HDAC6-217ENST00000469223 RNF169Q8NCN4 708 aa14.51□□□□□ -0.09
HDAC6-217ENST00000469223 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.51□□□□□ -0.09
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