RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468886.5

GCOM1-205, Transcript of GRINL1A complex locus 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GCOM1, Length 2,508 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCOM1-205ENST00000468886 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 GNGT1P63211 74 aa16.06■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 SLC15A2Q16348 729 aa16.06■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 MSL1Q68DK7 614 aa16.06■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa16.06■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 CCDC174Q6PII3 467 aa16.06■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 C1orf186Q6ZWK4 172 aa16.06■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 PEX26Q7Z412 305 aa16.06■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.06■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 GAS7O60861 476 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 PSMD10O75832 226 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 SLITRK3O94933 977 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 POLR2MP0CAP2 368 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 ECE1P42892 770 aa16.05■□□□□ 0.16
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GCOM1-205ENST00000468886 PPP2R5CQ13362 524 aa16.05■□□□□ 0.16
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GCOM1-205ENST00000468886 SYCE1Q8N0S2 351 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 ACTRT1Q8TDG2 376 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 IKZF4Q9H2S9 585 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 INTUQ9ULD6 942 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa16.05■□□□□ 0.16
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GCOM1-205ENST00000468886 UBE4BO95155 1302 aa16.05■□□□□ 0.16
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GCOM1-205ENST00000468886 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.161e-13■■■■■ 33.4
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GCOM1-205ENST00000468886 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 NFIL3Q16649 462 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 AOC3Q16853 763 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 FAM178BQ8IXR5 827 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 SLC5A5Q92911 643 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 BORCS6Q96GS4 357 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 SEL1LQ9UBV2 794 aa16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 FRMPD4Q14CM0 1322 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 H0YIN7 160 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 KRT14P02533 472 aa16.04■□□□□ 0.16
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GCOM1-205ENST00000468886 FMO5P49326 533 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 IQCKQ8N0W5 287 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 GOPCQ9HD26 462 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.04■□□□□ 0.16
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GCOM1-205ENST00000468886 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
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GCOM1-205ENST00000468886 COG2Q14746 738 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 TRADDQ15628 312 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 KCTD16Q68DU8 428 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 DAAM2Q86T65 1068 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 KSR1Q8IVT5 923 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 METTL13Q8N6R0 699 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 SCFD2Q8WU76 684 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 AKT1S1Q96B36 256 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 ISCUQ9H1K1 167 aa16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 ZNF233A6NK53 670 aa16.03■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.03■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.03■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 NACC1Q96RE7 527 aa16.03■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 AP1M1Q9BXS5 423 aa16.03■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 F8VZ95 297 aa16.03■□□□□ 0.16
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GCOM1-205ENST00000468886 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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GCOM1-205ENST00000468886 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 ACER1Q8TDN7 264 aa16.03■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 STK33Q9BYT3 514 aa16.03■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 WDR11Q9BZH6 1224 aa16.03■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.03■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 GRIN2DO15399 1336 aa16.02■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 A6NNZ2 444 aa16.02■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.02■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 CCDC188H7C350 402 aa16.02■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 KRIT1O00522 736 aa16.02■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 MUTP22033 750 aa16.02■□□□□ 0.16
GCOM1-205ENST00000468886 CCT5P48643 541 aa16.02■□□□□ 0.16
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