RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 LGALS2P05162 132 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ASGR1P07306 291 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PSAPP07602 524 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CST5P28325 142 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CDC25AP30304 524 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SFNP31947 248 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 JAK3P52333 1124 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ACLYP53396 1101 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CHMP4BP1P59074 171 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SPECC1Q5M775 1068 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF787Q6DD87 383 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM50Q86XT4 487 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 FERMT2Q96AC1 680 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 DYDC2Q96IM9 177 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SPATA32Q96LK8 384 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CSRNP2Q9H175 543 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF302Q9NR11 478 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 EVPLQ92817 2033 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A087WWV3 80 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 KBTBD13C9JR72 458 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 LGR5O75473 907 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 MARK3P27448 753 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 STAT5BP51692 787 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SOX10P56693 466 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMC6P62333 389 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CYP4A11Q02928 519 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PDIA5Q14554 519 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 EPHA7Q15375 998 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 NR6A1Q15406 480 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 UGCGQ16739 394 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 IGSF22Q8N9C0 903 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 BANK1Q8NDB2 785 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 KAT2BQ92831 832 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 GLG1Q92896 1179 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 AZI2Q9H6S1 392 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 RGL1Q9NZL6 768 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PHF24Q9UPV7 400 aa9.44□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 EMSYQ7Z589 1322 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PQY0 241 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 H3BRB1 525 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 DNM1LO00429 736 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 KPNA6O60684 536 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PPP6R2O75170 966 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 MED24O75448 989 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP4AP20648 1035 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ME1P48163 572 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMC5P62195 406 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 USP49Q70CQ1 688 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 TPH2Q8IWU9 490 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 RDM1Q8NG50 284 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 PLIN2Q99541 437 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB34Q9BZG1 259 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ARID2Q68CP9 1835 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.42□□□□□ -0.9
ANKRD28-208ENST00000463533 ZBTB39O15060 712 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms