RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 USP11P51784 963 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRKCEQ02156 737 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DSC3Q14574 896 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 COL19A1Q14993 1142 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PTPROQ16827 1216 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 INF2Q27J81 1249 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BLIDQ8IZY5 108 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NECAB1Q8N987 351 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SAMD11Q96NU1 681 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RGS18Q9NS28 235 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RNF19AQ9NV58 838 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CLDND1Q9NY35 253 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SQORQ9Y6N5 450 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIAA1671Q9BY89 1806 aa8.65□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-220ENST00000454996 COL1A2P08123 1366 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C5orf42Q9H799 3197 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PER2O15055 1255 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZBTB39O15060 712 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GAS7O60861 476 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DEXIO95424 95 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 OATP04181 439 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RB1P06400 928 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CYP3A7P24462 503 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PBX3P40426 434 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FAM189BP81408 668 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 Q4G0T1 1027 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KSR1Q8IVT5 923 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MBOAT7Q96N66 472 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CWH43Q9H720 699 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AKT3Q9Y243 479 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WDR81Q562E7 1941 aa8.64□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 A0A087WWV3 80 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DENND3A2RUS2 1198 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WDR64B1ANS9 1081 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WNT7AO00755 349 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CPLX1O14810 134 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PFKFB2O60825 505 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TBX10O75333 385 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GPC3P51654 580 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FOSBP53539 338 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AK2P54819 239 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ERVFC1P60507 584 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ST3GAL1Q11201 340 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ADAM15Q13444 863 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ME3Q16798 604 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LETM2Q2VYF4 491 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LONRF3Q496Y0 759 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MTERF2Q49AM1 385 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLA2G4FQ68DD2 849 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANO5Q75V66 913 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BICD2Q8TD16 824 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 POF1BQ8WVV4 589 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HAS1Q92839 578 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CASD1Q96PB1 797 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RIT2Q99578 217 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NRBP2Q9NSY0 501 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CLEC1BQ9P126 229 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa8.63□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NCOR1O75376 2440 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms