RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 MAP7D2Q96T17 732 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.94■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 DNAJB2P25686 324 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 TMOD1P28289 359 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 ECM1Q16610 540 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 BRAPQ7Z569 592 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 KSR1Q8IVT5 923 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 NME8Q8N427 588 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 TMEM143Q96AN5 459 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 SCLT1Q96NL6 688 aa22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 GPR32O75388 356 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 BAIAP3O94812 1187 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 CLIC4Q9Y696 253 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 UPP2O95045 317 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 FGFR4P22455 802 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 DEFB123Q8N688 67 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 ERMNQ8TAM6 284 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 NEK9Q8TD19 979 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 PADI3Q9ULW8 664 aa22.92■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 SIP14410 1827 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 PAK2Q13177 524 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 PKP1Q13835 747 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 NLRP7Q8WX94 980 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.91■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 GPC3P51654 580 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 EMC2Q15006 297 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 TIFAQ96CG3 184 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 NLRP4Q96MN2 994 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 PLIN2Q99541 437 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 WDR81Q562E7 1941 aa22.9■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 LAD1O00515 517 aa22.89■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 RPS6KA5O75582 802 aa22.89■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 GRIN1Q05586 938 aa22.89■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.89■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 SLC9A7Q96T83 725 aa22.89■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.89■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PTX4-203ENST00000447419 CDH23Q9H251 3354 aa22.89■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 ARHGEF15O94989 841 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 LYPLA2O95372 231 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 RPA1P27694 616 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 PRPHP41219 470 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 RARRES1P49788 294 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 DNM2P50570 870 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 FAM228AQ86W67 206 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 TMX1Q9H3N1 280 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 POLD4Q9HCU8 107 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 MSRAQ9UJ68 235 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.88■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 A0A087WZ62 844 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 LCHNA4D1U4 455 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 APBB2Q92870 758 aa22.87■■□□□ 1.25
PTX4-203ENST00000447419 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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