RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 MARCH6O60337 910 aa22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 MGEA5O60502 916 aa22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 GPR32O75388 356 aa22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 NECAB1Q8N987 351 aa22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 RDM1Q8NG50 284 aa22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 WASF1Q92558 559 aa22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 GRM6O15303 877 aa22.03■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 GATMP50440 423 aa22.03■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 MTERF2Q49AM1 385 aa22.03■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 NEK8Q86SG6 692 aa22.03■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 FAM228AQ86W67 206 aa22.03■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.03■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.03■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.02■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 TTC3P53804 2025 aa22.02■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 SLC37A4O43826 429 aa22.02■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.02■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.02■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 OXER1Q8TDS5 423 aa22.02■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 PLVAPQ9BX97 442 aa22.02■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 RGS18Q9NS28 235 aa22.02■■□□□ 1.12
NPAS1-201ENST00000439365 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 CTDNEP1O95476 244 aa22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 LINC00271P0C7V0 271 aa22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 NEK4P51957 841 aa22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 XKR3Q5GH77 459 aa22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 NLRP7Q8WX94 980 aa22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 MBOAT7Q96N66 472 aa22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.01■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 EVPLQ92817 2033 aa22■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM150BA6NC51 233 aa22■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 TBKBP1A7MCY6 615 aa22■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 ME3Q16798 604 aa22■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 H3BQ06 376 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 LARGE1O95461 756 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 KRT2P35908 639 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 DNM2P50570 870 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 FOSBP53539 338 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 LEXMQ3ZCV2 418 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 FAM102BQ5T8I3 360 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 GTF3C6Q969F1 213 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 FAM20AQ96MK3 541 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 CLDND1Q9NY35 253 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.99■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 C9IYK1 514 aa21.98■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 GPC3P51654 580 aa21.98■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 PSMC5P62195 406 aa21.98■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.98■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.98■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.98■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 P2RX5Q93086 422 aa21.98■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 IGFLR1Q9H665 355 aa21.98■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 MMP1P03956 469 aa21.97■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 FGFR1P11362 822 aa21.97■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 FGFR4P22455 802 aa21.97■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM29Q14134 588 aa21.97■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 NAALADL2Q58DX5 795 aa21.97■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 RNF169Q8NCN4 708 aa21.97■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.97■■□□□ 1.11
NPAS1-201ENST00000439365 AAASQ9NRG9 546 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms