RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPG21Q9NZD8 308 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NYAP2Q9P242 653 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRK2Q5S007 2527 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C2CD2LO14523 706 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GNAT1P11488 350 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CA8P35219 290 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDK8P49336 464 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SARSP49591 514 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LAMC2Q13753 1193 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNERQ8NFT8 737 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GAB3Q8WWW8 586 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FGF14Q92915 247 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF558Q96NG5 402 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C16orf70Q9BSU1 422 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FLNCQ14315 2725 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATG2BQ96BY7 2078 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 B4DLN1 442 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CD52P31358 61 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIP4P1Q86T03 277 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COPRSQ9NQ92 184 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF76P36508 570 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAM17P78536 824 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM102BQ5T8I3 360 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PARM1Q6UWI2 310 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WBP1Q96G27 269 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZBP1Q9H171 429 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NUP205Q92621 2012 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KAT6AQ92794 2004 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TFCP2Q12800 502 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UAP1L1Q3KQV9 507 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC30A10Q6XR72 485 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRT25Q7Z3Z0 450 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM160B2Q86V87 743 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPEM1Q8N4L4 309 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP44Q9H0E7 712 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SQORQ9Y6N5 450 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPRBP23467 1997 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MGAQ8IWI9 3026 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITPR2Q14571 2701 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR81Q562E7 1941 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UPK3BL1B0FP48 263 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UPK3BL2E5RIL1 263 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VAMP4O75379 141 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STAT2P52630 851 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GAS6Q14393 721 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC39A11Q8N1S5 342 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LMAN1LQ9HAT1 526 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCPG1Q9ULG6 757 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPDC1A2A3K4 754 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPP40O75818 363 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PAPLNO95428 1278 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CAVIN2O95810 425 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BMP3P12645 472 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLCN4P51793 760 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEPT14Q6ZU15 432 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C16orf86Q6ZW13 317 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHURC1Q8WUH1 139 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SETD4Q9NVD3 440 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM232C9JQI7 657 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 H3BRB1 525 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NFIBO00712 420 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAN2B1O00754 1011 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AKAP3O75969 853 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CTSAP10619 480 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C6P13671 934 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CALML3P27482 149 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PBX3P40426 434 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTSS1LQ765P7 747 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR155Q7Z3F1 870 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AUTS2Q8WXX7 1259 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNMT3LQ9UJW3 386 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms