RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429205.6

SENP3-202, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SENP3, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-202ENST00000429205 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 GMEB1Q9Y692 573 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 C19orf81C9J6K1 198 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ZBED4O75132 1171 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 MED24O75448 989 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TADA3O75528 432 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 FNTAP49354 379 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PDE4DQ08499 809 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 MPP3Q13368 585 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 VGLL4Q14135 290 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PTPN21Q16825 1174 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 DYMQ7RTS9 669 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 FUT8Q9BYC5 575 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 EXOC1Q9NV70 894 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 VAV3Q9UKW4 847 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.7□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 E9PMD0 336 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 FCER1AP12319 257 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 STK4Q13043 487 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CEP55Q53EZ4 464 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 HPS3Q969F9 1004 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CEP104O60308 925 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PSMD7P51665 324 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SLC7A5Q01650 507 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 FAM71BQ8TC56 605 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 DDX12PQ92771 950 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TRIM4Q9C037 500 aa14.69□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 POTEFA5A3E0 1075 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 POTEIP0CG38 1075 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SMTNP53814 917 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PMS1P54277 932 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 GHRHRQ02643 423 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 BRD3Q15059 726 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 POTEGQ6S5H5 508 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 RIPK3Q9Y572 518 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 EML1O00423 815 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 MEIS1O00470 390 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 EBAG9O00559 213 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 FANCGO15287 622 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 DSG3P32926 999 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 TUBB4BP68371 445 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 UNC13DQ70J99 1090 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 REPS2Q8NFH8 660 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 IL31RAQ8NI17 732 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 DNAI1Q9UI46 699 aa14.68□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 RPTORQ8N122 1335 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PSMD10O75832 226 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 PLA2G4BP0C869 781 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 FDX1P10109 184 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ARP10275 920 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 IDEP14735 1019 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 KCNA2P16389 499 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 RPA1P27694 616 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 EPHX2P34913 555 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 COG2Q14746 738 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 ARMC3Q5W041 872 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.67□□□□□ -0.06
SENP3-202ENST00000429205 VSTM4Q8IW00 320 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms