RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424263.6

PRDM11-201, Transcript of PR/SET domain 11, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene PRDM11, Length 1,858 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM11-201ENST00000424263 PADI6Q6TGC4 694 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 USP25Q9UHP3 1055 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 TREHO43280 583 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 NR1I2O75469 434 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 ZNF202O95125 648 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 SLFN14P0C7P3 912 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 LONRF3Q496Y0 759 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.17■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 MAFO75444 373 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 DGAT1O75907 488 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 KLRC1P26715 233 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 EMC2Q15006 297 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 MTRQ99707 1265 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 TNMDQ9H2S6 317 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.16■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 SYCE3A1L190 88 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 MAGEB2O15479 319 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 B4GALT4O60513 344 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 PTGISQ16647 500 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 TRIM60Q495X7 471 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 DACT1Q9NYF0 836 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 CYP11B2P19099 503 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 ZNF445P59923 1031 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 SV2BQ7L1I2 683 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 SERINC5Q86VE9 423 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 GPBP1Q86WP2 473 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 KCND2Q9NZV8 630 aa22.15■■□□□ 1.14
PRDM11-201ENST00000424263 CD4P01730 458 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 ARSHQ5FYA8 562 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.14■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 RTP1P59025 263 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 TOX2Q96NM4 488 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 CYP2C9P11712 490 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 GUCY2CP25092 1073 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 DRP2Q13474 957 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 RETREG2Q8NC44 543 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 STAMQ92783 540 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 WNT8BQ93098 351 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 TIGD1Q96MW7 591 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.13■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 MYMKA6NI61 221 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 CLCN3P51790 818 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 TLE2Q04725 743 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 CNNM3Q8NE01 707 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 PAGE5Q96GU1 130 aa22.12■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 PTK7Q13308 1070 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 METTL13Q8N6R0 699 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 NOD1Q9Y239 953 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 KINO60870 393 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 MAPK7Q13164 816 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 DAW1Q8N136 415 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 DDX12PQ92771 950 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 TMEM143Q96AN5 459 aa22.11■■□□□ 1.13
PRDM11-201ENST00000424263 REEP2Q9BRK0 252 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms